桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析

来源 :遗传 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woaijiekexun
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
WRKY转录因子是植物中最大的转录调控家族之一,在生物和非生物胁迫以及植物生长和发育过程中起着重要调控作用。本文利用HMMER 3.0软件,使用WRKY保守域全蛋白序列(Pfam数据库编号:PF03106)鉴定桃(Prunus persica L.)基因组中的WRKY基因;利用DNAMAN 5.0、Web Logo 3、MEGA5.1、Map Inspect和MEME等软件对其蛋白序列进行生物信息学分析。本文共鉴定得到61个桃WRKY基因。进化树分析结果显示,桃WRKY蛋白分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类型,类型Ⅰ分为Ⅰ-C亚组和Ⅰ-N亚组,类型Ⅱ分为Ⅱ-a、II-b、II-c、II-d和II-e亚组。WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结构。染色体定位分析显示,桃WRKY基因分布于8条染色体中,呈不均匀分布。内含子和外显子结构分析表明,WRKY基因结构进化高度保守。保守元件分析表明,桃WRKY基因家族包含5个保守元件,元件1、2和3为WRKY盒,元件4、5为未知盒。桃WRKY基因家族都包含有WRKY盒,类型Ⅰ中含有2个WRKY盒;II-d亚组中含有未知元件5。半定量和荧光定量PCR结果显示,16个WRKY基因均在桃的根、茎、叶、花和果中表达,但其相对表达水平不同。
其他文献
研究目的:通过对加味育阴汤治疗肾阴虚型经断前后诸证的临床研究,探讨加味育阴汤治疗肾阴虚型经断前后诸证的有效性,为临床应用提供较好的理论依据和有效的治疗方案。研究方
数学教育的一个重要目的使每个学生都得到发展。而据有关资料表明,目前在初中数学学习中,约有60%的学生普遍存在学习困难现象。如果将这么多学困生放任自流,那么实施素质教育,使每
小马丁·路德·金深受正义、博爱、顺从等这些黑人宗教观念的影响 ,他也将宗教当做一个为正义和自由而战的武器 ,用自由的新教神学来阐述他对美国宗教的看法 ,努力提醒白人在
FRP复合材料由于具轻质高强以及优良的耐腐蚀性,在土木工程领域得到了广泛的应用。学者们提出了许多应用FRP材料的组合柱形式,其中,FRP管混凝土柱与FRP-混凝土-钢双壁空心管柱近年来得到了广泛研究。椭圆形截面拥有强轴和弱轴之分,可根据工程需要进行灵活的截面布置,且造型优美多变,为建筑设计提供更多选择。此外,椭圆形截面柱是矩形截面柱的有效优化改善形式。因此,椭圆形FRP管混凝土柱和椭圆形FRP-混
在当今社会信息化快速发展的时期,加强高校就业信息化建设,是适应信息化时代发展的客观需求和强化毕业生就业服务的有效途径。根据高校信息化建设的基本原则,探索高校就业信息化
幼儿教育小学化是当前幼儿园教育中普遍存在的问题,为幼儿教育发展带来了不利影响,严重损害了幼儿的身心健康。因此,教师应该正确认识到幼儿教育小学化的危害,及时采取有效的解决
本课题从互联网环境中场景理论入手,结合场景技术的应用和产品设计流程,提出了场景四要素:场景视觉塑造、场景信息构建、场景行为引导和场景情感影响力,并逐一进行分析。根据设计心理学、信息体验设计、场景理论和探究方法,结合用户常规体验流程与用户成长信息系统的使用阶段,提出了互联网产品中用户成长信息系统的“场景塑造的表象层-场景构建的认知层-场景规划的路径层-场景影响力的感知层”四个场景层次,分别提出了对应
目的:探讨用盐酸氨溴索对老年慢性支气管炎患者进行雾化吸入治疗的临床效果。方法:选取近年来我院呼吸内科收治的146例老年慢性支气管炎患者作为研究对象。随机将这些患者分为
现阶段,如何培养学生的英语学习动机,提高学生英语学习的效率已经成为初中英语教学最重要的任务。本文结合多年的英语教学经验,对初中生英语学习动机的培养提出了相应的解决
一、借助教材的优势,把思考的权利还给学生  转变教师的教学行为,要激发学生求知的主动性,使教学过程成为一个在教师指导下学生主动求知的过程。当前,许多语文教师的教学方法属于知识传授型,对于课堂上的问题,应该给学生思考的时间及表现的机会,一切思维都是从问题开始的,要认识到,教学要促进学生思维就应当培养学生的问题意识。《语文课程标准》提出要“爱护学生的好奇心和求知欲”,充分激发学生的主动意识和进取精神。