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运用Visual Modflow软件对万家口子水电站拱坝坝基渗流进行了模拟研究，用六面体单元精确模拟了排水孔孔径、孔深和孔距及帷幕的空间分布，同时对影响渗流场主要的渗流通道，如不整合面、断层、裂隙带等进行了精确模拟，在此基础上分析了坝基渗流场分布规律。综合评估了坝基渗流场的主要渗流特性、宏观渗流控制能力和局部渗流控制薄弱环节。研究表明，不整合面对坝基渗流特性影响很大，建议施工时应尽量开挖到不整合面以下，或将帷幕穿透不整合面以提高帷幕的防渗效果。