【摘 要】
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对寡氧单胞菌基因组中的CRISPR位点进行生物信息学分析。CRISPRdb数据库中公布的和NCBI上下载的共26株寡氧单胞菌的基因组序列，分析其CRISPR位点的分布情况、重复序列、间隔序
【机 构】
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青岛大学医学部微生物学教研室,青岛市市立医院
【基金项目】
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山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(BS2011SW0005);山东省科技攻关基金项目(2007GG3WZ05009)
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对寡氧单胞菌基因组中的CRISPR位点进行生物信息学分析。CRISPRdb数据库中公布的和NCBI上下载的共26株寡氧单胞菌的基因组序列，分析其CRISPR位点的分布情况、重复序列、间隔序列以及间隔序列和噬菌体序列数量之间的关系。共发现15个确定的CRISPR结构和132个可疑的CRISPR，不同菌株CRISPR结构中的重复序列具有较强的保守性。间隔序列的靶向基因主要来自细菌的基因组，说明寡氧单胞菌CRISPR的的进化与其他细菌基因有关。此外，间隔序列与前噬菌体数量之间的负相关关系，说明CRISPR能阻止
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