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为了制定科学的资源保护策略、促进其开发利用以及新品种的选育,对西南地区55份野生狗牙根材料,联合采用SSR和AFLP方法分析其遗传多样性。通过进行引物筛选,筛选出有效引物组合18对和11对;SSR和AFLP扩增总条带353和626条,多态性条带267和592条,平均每对引物扩增出多态性条带19.61和53.83条,多态性位点百分率为75.10%和94.57%。聚类分析表明GS=0.806时,可将所有供试材料分成6个组群,当GS=O.82时,可将第V1个组群分成4个小组,当GS=0.836时,第V1组群中第