【摘 要】
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探讨19种戈登氏菌共31株间16S rRNA基因演化关系。利用16S rRNA基因序列进行相似性分析和同源性比对,并运用Neighbor-Joining法构建进化树,进行演化分析。其中13条16S rRNA基
【机 构】
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武汉轻工大学生物与制药工程学院,南阳市第一中学
【基金项目】
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湖北省教育厅科学技术研究计划重点项目(D20121809)
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探讨19种戈登氏菌共31株间16S rRNA基因演化关系。利用16S rRNA基因序列进行相似性分析和同源性比对,并运用Neighbor-Joining法构建进化树,进行演化分析。其中13条16S rRNA基因序列来自临床分离株,其他16S rRNA基因序列来自Genbank。结果表明:13株临床分离菌株包含4株Gordonia paraffinivorans,6株Gordonia bronchialis和3株Gordonia sputi,临床分离株的相似性百分比为93.5%-99.7%;16S rRNA基因序列在戈登氏菌不同种间存在较为明显的差异性(2%—6.2%),可将临床分离株鉴定到种。进化分析结果显示:戈登氏菌分为两大类群,三种临床分离株在演化上按出现的先后依次为Gordonia bronchialis、Gordonia sputi、Gordonia paraffinivorans。所做研究可为戈登氏菌相关疾病的流行、预防、治疗和控制提供一定的参考。
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