蛋白质结构限制性对HIV-1耐药相关基因分子进化规律的影响研究

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hwen1023
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

通过对65名HIV治疗队列中发生耐药的感染者进行较系统的前瞻性队列研究,阐明我国抗病毒治疗过程中,HIV RT蛋白耐药进化的结构限制性以及HIV耐药的发生规律。

方法

从2003年开始,每半年1次,连续4年对队列感染者进行随访采集静脉血样,提取病毒RNA后对RT基因进行RT-PCR扩增和测序。将所获得的序列进行系统进化、耐药位点变异和蛋白质结构分析。

结果

RT酶中大部分的氨基酸位点都是保守的,而序列的变异仅发生在12.44%的位点之上。非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)高水平耐药位点多位于RT蛋白的内部,而中等水平耐药位点多位于蛋白质的表面。核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)高水平耐药位点均位于RT蛋白的表面,而低水平耐药位点均位于RT蛋白的内部。

结论

NNRTI和NRTI类耐药突变位点在RT蛋白中截然相反的分布特征,可以为针对RT靶点的抗病毒药物的设计和开发起到一定的指导作用。

其他文献
目的研究滤泡性辅助性T细胞(follicular helper T cells, Tfh)各亚群在不同免疫分期的乙型肝炎患者中的分布以及CXCL13与Tfh亚群分布之间的关系。方法流式细胞术检测Tfh细胞各个亚群在乙型肝炎患者中的分布。ELISA检测乙型肝炎患者血清中CXCL13的含量。RT-PCR及Western blot检测CXCL13在HepG2和HepG2.2.1.5细胞中的表达水平。结果
目的了解产肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)大肠埃希菌的流行情况,加强医院感染控制及防止多重耐药菌大范围播散。方法收集2012年7月至2014年1月杭州市中医院、浙江大学医学院附属第一医院、浙江省中医院和浙江省人民医院共25株碳青霉烯类抗生素耐药大肠埃希菌。利用K-B纸片法测试所有菌株对22种常用抗菌药物的敏感性;PCR扩增确认blaKPC基因,改良Hodge试验确认菌株是否产碳青霉烯酶;脉冲场凝胶
为制备新城疫病毒(NDV)中强毒株核酸检测阳性标准参考样品,本研究以NDV中强毒株RNA为模板,设计NDV融合蛋白F基因特异性引物,通过RT-PCR扩增全长F基因,克隆于pGEM-T载体中,采