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信息技术在各个领域的广泛应用也促使生物科学技术的变革,利用计算机系统平台解决基因表达数据时间序列的相似查询有多种方法,本文介绍了一个最常用的算法——在动态时间规整算法基础上进行优化的多分段动态时间规整算法,本文主要研究使用多分段的动态时间规整算法对酵母的基因表达数据进行序列比对,主要从计算速度,时间复杂度,比对精度等方面进行了实验分析。