论文部分内容阅读
日前,采用刀片架构的浪潮天梭10000在北京生命科学研究所上线运行,这套高性能计算系统峰值计算能力超过14万亿次,成为我国生命科研领域浮点计算能力的新高峰,相比原有系统,作业运行时间减少了50%以上,有效提高了该所的科研效率。
优中选优 用性能说话
在系统招标初期,该所要求各投标厂商先期提供设备进行测试,目前实验室的主要应用有用于分子对接的DOCK软件,以及蛋白质分子模拟软件Charmm等。其中Charmm是一个被广泛承认并应用的分子动力学模拟程序,主要用于生物大分子的模拟,包括能量最小化,分子动力学和蒙特卡罗模拟等,测试方案是用生命所最常用的软件Charmm对各家机器进行Benchmark测试,并根据实际运行时间和IO能力进行综合打分,以作为评标参考。
结果在由生科所主持的Charmm以及系统I/O性能测试中,浪潮在4家厂商送测的5款产品中以绝对优势胜出,在同处理器配置下两项成绩高出平均水平20%以上,实测系统I/O速度高达87.5MB/S,浪潮天梭高性能解决方案一举胜出。
高密度 高性能 生命探索新引擎
基于NX7100DB刀片服务器的浪潮天梭TS10000高性能计算系统具有高密度、易维护、易扩展等特点。该集群在有限的空间内部署了100个计算节点,能够提供多达800颗计算核心,峰值计算能力达到7.5万亿次,计入已有的102节点,峰值能力达到14万亿次,成为生命科学领域的第一个浮点高峰。100个刀片节点,仅占用10个机箱空间,实际部署不到3个机架。随机配送的浪潮天梭监控管理软件针对服务器节点的运行状态,实现实时监控和管理,发现故障时在控制台端向管理员报警,为系统管理员提供了一个统一、集中、可视化、跨平台的远程管理环境。
优中选优 用性能说话
在系统招标初期,该所要求各投标厂商先期提供设备进行测试,目前实验室的主要应用有用于分子对接的DOCK软件,以及蛋白质分子模拟软件Charmm等。其中Charmm是一个被广泛承认并应用的分子动力学模拟程序,主要用于生物大分子的模拟,包括能量最小化,分子动力学和蒙特卡罗模拟等,测试方案是用生命所最常用的软件Charmm对各家机器进行Benchmark测试,并根据实际运行时间和IO能力进行综合打分,以作为评标参考。
结果在由生科所主持的Charmm以及系统I/O性能测试中,浪潮在4家厂商送测的5款产品中以绝对优势胜出,在同处理器配置下两项成绩高出平均水平20%以上,实测系统I/O速度高达87.5MB/S,浪潮天梭高性能解决方案一举胜出。
高密度 高性能 生命探索新引擎
基于NX7100DB刀片服务器的浪潮天梭TS10000高性能计算系统具有高密度、易维护、易扩展等特点。该集群在有限的空间内部署了100个计算节点,能够提供多达800颗计算核心,峰值计算能力达到7.5万亿次,计入已有的102节点,峰值能力达到14万亿次,成为生命科学领域的第一个浮点高峰。100个刀片节点,仅占用10个机箱空间,实际部署不到3个机架。随机配送的浪潮天梭监控管理软件针对服务器节点的运行状态,实现实时监控和管理,发现故障时在控制台端向管理员报警,为系统管理员提供了一个统一、集中、可视化、跨平台的远程管理环境。