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同源盒基因（homeobox genes）是一类含有共同的183个核苷酸序列（即同源盒）的调节基因，它所编码的间源盒蛋白作为转录因子，对下游的靶基因具有调节作用。这一类基因在生物进化中具有高度保守性，是生物发育分化的主控基因，对DNA合成的转录过程起调控作用。神经系统发育分化的调控受多种相关因素的影响，其中同源盒基因在神经系统的早期发育分化，特别是在决定神经纵轴的前后差异，以及个别神经组织的特异化方面起关键性作用。