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自20世纪90年代后期．随着蛋白质组概念的提出和基因组测序工作的快速进行，尤其是双向电泳技术的改进和生物质谱的大范围应用，蛋白质组学研究进入了一个快速发展的十年。十年间．伴随着对蛋白质组分离技术分辨率和重复性的争论，以双向电泳为主的基于凝胶的分离技术和以反相色谱为主的液相色谱质谱技术都取得了迅猛而深入的发展。