近年来，国有资产流失，会计信息失真，经济犯罪等问题日渐严重，要从根本上解决这些问题。必须建立一套科学有效的内部会计控制制度。因为完善而有效的内部会计控制。对加强单位经营管理。保护单位财产安全。保证单位会计信息真实、完整等具有积极推动和促进作用。目前，随着市场经济的发展，企业之间的竞争日益加剧，内部控制已成为企业赖以生存和发展的有效管理工具，为了加强和规范企业内部控制，提高企业经营管理水平和风险防范能力，促进企业可持续发展，维护社会主义市场经济秩序和社会公众利益，根据国家有关法律法规，财政部会同证监会、审计署、银监会、保监会制定了《企业内部控制基本规范》，自2009年7月1日起在上市公司范围内施行，鼓励非上市的大中型企业执行。行政事业单位也必须建立健全内部控制制度。《会计法》第一十七条规定，国家机关、社会团体和企事业单位必须建立健全内部控制制度，以确保会计信息的真实可靠，国家财产的安全稳定。新《会计法》第二十七条规定：“各单位应当建立健全本单位内部会计监督制度，以确保会计信息的真实可靠及国家财产的安全。”按照我国财政部2001年6月发布的《内部会计控制规范一基本规范(试行)》，内部会计控制指的是事业单位为了提高会计信息质量，保护资产的安全、完整，确保有关法律法规和规章制度的贯彻执行等而制定和实施的一系列控制方法、措施和程序。
　　因此，健全事业单位的内部会计控制制度是急需解决的问题。财政部发布的《内部会计规范——基本规范(试行)》和《内部会计控制规范一货币资金(试行)》对内部控制的目标、原则、内容、方法等也相应地作出了明确规定。然而，由于事业单位财务会计工作的固有特性，有的单位虽有内控制度却执行不严，有的单位连起码的内控制度都没有制定，更谈不上实行有效的内控措施了，这就在某种程度上造成了事业单位财务支出失控，会计信息失真等诸多弊端。
　　
　　一、当前事业单位内部会计控制存在的问题 　
　　(一)管理当局认识不足，有章不循和无章可循的现象较为突出。
　　目前大部分事业单位对建立内部会计控制制度不够重视：有的并未建立内部会计控制制度；有的内部会计控制制度残缺不全；还有的一些领导干部认为内部会计控制就是一堆堆的手册、文件和制度等；更为严重的是有章不循，执法不严，使内部会计控制制度流于形式，只是将已建立的一套内部会计控制制度“写在纸上，贴在墙上”就算完事，而不管内部会计控制制度的执行情况如何。在经济业务活动中以强调灵活性为由而不按规定程序办理，使内部会计控制制度失去了应有的刚性和严肃性；有的甚至为了谋取个人利益而不择手段。弄虚作假，篡改帐目或摘账外账，隐匿或偷盗财物。
　　
　　(二)内部会计控制制度不完善，使财务控制存在漏洞。
　　大多数事业单位并没有建立内部牵制制度、财务处理程序制度、财务分析制度等基本内部会计控制制度。有的单位甚至没有严格的复核审批制度，款项的支取手段混乱，给记账与对账造成一定困难；有的单位现金管理失控；有的单位重钱轻物，对固定资产的管理没有尽到很好的受托责任，没有定期资产盘点制度，上下级之间调拨没有办理调拨手续，有的早已投入使用却没有入账，还有的私下低价处置固定资产，造成国有资产严重流失；还有一些单位对材料的管理也不十分严格，购入时直接记，大量材料被浪费；票据的管理更是混乱，随便领用，使相当一部分预算外资金体外循环。
　　
　　(三)内部会计控制的执行流于形式，奖罚不力。
　　一些单位虽然建立了较为完善的内控制度，但领导一句话，一笔须经过多个环节的业务便由一人办理完毕。账务处理程序也夹杂着个人关系、感情，有时出现逆流现象。单位的稽核，检查的范围也有限，以偏概全，以点带面，缺乏完整性和全面性。内部会计控制制度执行的好坏，一直以来，政府有关部门都一视同仁，缺乏一个奖罚有度的奖罚制度，从而导致会计信息失真，贪污腐败现象发生。
　　
　　(四)内部控制组织机构和岗位设置不合理，使内部控制防范职务犯罪的功能难以发挥。
　　一是在组织机构和岗位设置上，不相容职务相互分离的原则没有得到充分体现；二是在机构和岗位设置上，体现了相互分离的原则，但在实际运行中没有按照相互分离的原则去实施；三是相关人员在履行自己的职责时不能按制度原则办事，而是以唯权、唯亲和唯情为准则，这就导致内部控制的防范性功能不能得到充分发挥；第四，缺乏应有的内部审计和监督体系。内部会计控制与内部审计监督制度是辩证统一的关系，内部会计控制是内部审计监督的基础，内部审计监督促进内部控制的不断完善。目前事业单位内部缺乏有效的内部审计和监督。
　　
　　二、加强行政事业单位内部会计控制的对策
　　
　　(一)加强领导，健全财会管理体制。单位负责人应切实加强对本单位会计工作的领导，要明确单位负责人是第一负责人，增强单位负责人的法制意识，促使单位负责人提高对会计工作的重视程度，提高自我约束，规范单位会计行为。财政部门应加强对行政事业单位财会工作的管理。首先，财政部门应当依据部门预算的要求，不断完善符合公共财政框架的财会管理控制制度，指导行政事业单位内部财会管理工作；其次，财政部门应建立起“从预算编制到执行。再到决算”的全过程监督体系，发挥财政部门在行政事业单位财会管理工作中的事前论证，事中控制，事后问效等功能；再次，财政部门应推动事业单位内部财会管理的改革，强化单位领导的重视意识，重塑财会管理的角色，合理财会部门的设置，提高财会人员的素质，规范单位财会管理的运作，促进财会管理在各单位的内部管理中的作用。
　　(二)建立继续教育长效机制，培养高素质会计人才。会计人员素质高低会直接影响会计信息质量，加强对会计人员的监督管理，提高会计队伍的整体素质，是强化单位内部会计控制的必然要求。各级会计人员和会计管理人员要增强紧迫感和责任心，除了自身主动学习新知识、新技能外，其所在单位应提供必要的物力财力，支持会计工作。改善执业环境。财政部门要加强会计业务培训。建立起个人、单位、财政三位一体的会计人员继续教育长效机制。
　　(三)建立健全内部控制制度，提高财务管理水平。单位会计内部控制是一个发现问题、解决问题、再发现问题、再解决问题的循环往复的过程。内部控制不是简单的制定一项制定或做一个固定的操作，也不只局限于某个人、某个环节、某一事项或某个载体的控制，而是对整个经济活动全过程实施的动态监督和控制。通过预算收支情况分析、开支水平分析、人员增减情况分析及固定资产利用情况分析等，能够发现问题。总结经验教训，不断完善内部会计控制。因此，在制定内部控制制度中，要把握三个方面：一是以顶防控制为主，事后控制为辅，防止发生无效率或不法行为。二是注重程序制约，对主要业务的控制，必须经过授权、批准、执行、记录、检查等控制程序，特别是物资设备采购、基建项目招投标、对外投资、超预算的支出等。三是注重岗位职责牵制，在机构设置与岗位分工时，一定要明确各部门组织及上岗个人应承担的责任范围，并要规定追究、查处责任的措施与奖惩办法。
　　(四)加强日常管理，促进会计基础工作的规范化。一是注重岗位之间相互牵制作用，从而预防发生错误和弊端，做到防范于未然，以保证会计记录的真实与完整。二是认真抓好会计基础工作规范。把经济活动中与会计有关的重复出现的经济业务按照客观要求来规定其处理程序，使会计业务处理规范化、标准化。避免会计工作手续不严与职责不清的现象发生。三是建立完善的会计处理程序。按照会计处理程序所包括的会计科目的设置、会计凭证的审核传递、会计核算的方法、会计账簿设置与记账要求等内容。通过会计处理程序控制、手续控制和复核控制等措施，确保会计信息的真实性、及时性和完整性。四是严格内部核对制度。对已完成的经济业务记录进行复查核对，是强化内部控制制度的一项基本措施。是控制记录使其正确可靠的重要方法。会计复查核对主要在预算、经济业务的合法性、会计资料的合法性、真实性和财产物资安全性等方面加以控制。五是要建立实物资产管理岗位责任制，对实物资产的验收入库、领用、发出及处置等关键环节进行控制，重点是控制各个角落和环节，不留漏洞，形成一个相对独立的系统。
　　(五)加强内部审计，强化财政监督管理，形成监督合力。内审部门应建立定期的内控制度评价制度。及时发现内控制度的缺陷和薄弱环节。针对这些问题对症下药，制定改进措施。财政部门应加强对事业单位内部会计控制的指导和检查，定期或不定期会同审计，银行、纪检等国家机关和业务主管部门对事业单位进行例行检查和专项审计，对财务会计工作质量进行监督，对不依法设置会计账簿、私设会计账簿和设有账外账以及违反相关财政措施的单位，应依照相关法规和管理规定从严进行处罚，加大监管执法力度。