,Semantic Search among Heterogeneous Biological Databases Based on Gene Ontology

来源 :生物化学与生物物理学报(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:shining321
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Semantic search is a key issue in integration of heterogeneous biological databases. In thispaper, we present a methodology for implementing semantic search in BioDW, an integrated biological datawarehouse. Two tables are presented: the DB2GO table to correlate Gene Ontology (GO) annotated entriesfrom BioDW data sources with GO, and the semantic similarity table to record similarity scores derived fromany pair of GO terms. Based on the two tables, multifarious ways for semantic search are provided and thecorresponding entries in heterogeneous biological databases in semantic terms can be expediently searched.
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