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对１０份粒色不同的栽培和野生芝麻的染色体组型研究表明，栽培芝麻染色体数目一致，核型基本相同：２ｎ＝２６＝１２ｍ＋１２Ｓｍ＋２Ｓｔ随着粒色的变浅，核型的不对称性加强，有两对随体染色体。野生芝麻核型与栽培芝麻相似：２ｎ＝２６＝１２ｍ＋１２Ｓｍ（４ＳＡＴ）染色体数目有２ｎ＝２６，２ｎ＝３２，２ｎ＝５８或２ｎ＝６４．芝麻可能是由对称核型向不对称核型演化，其趋势为：野生（２ｎ＝２６）－黑粒－褐袜－黄粒－白粒