基于共表达网络分析的Ⅰ期胃癌预后基因筛选

来源 :中国医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yuswe

【摘要】

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目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选Ⅰ期胃癌(SIGC)的预后因子并探讨其分子机制。方法通过WGCNA分析癌症基因组图谱(TCGA)中SIGC患者的临床数据,筛选影响SIGC预后的

【作者】

：

礼想杨博文宫丽宝臧丹张朝旭张闯李智曲秀娟

【机构】

：

中国医科大学附属第一医院肿瘤内科

【出处】

：

中国医科大学学报

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

胃癌脑酸可溶性蛋白1 加权基因共表达网络分析转移 gastric cancer BASP1 weighted gene co-expression netw

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81972331,81972751,81572374),国家重点研发计划(2017YFC1308900),辽宁省高等学校基本科研项目(LFWK201706)

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目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选Ⅰ期胃癌(SIGC)的预后因子并探讨其分子机制。方法通过WGCNA分析癌症基因组图谱(TCGA)中SIGC患者的临床数据,筛选影响SIGC预后的基因,并通过体外实验验证该基因对预后的影响。通过基因组富集分析(GSEA)进一步探索其影响胃癌预后的机制。结果TCGA中共有胃癌数据330例,其中SIGC数据51例。脑酸可溶性蛋白1(BASP1)基因高表达患者的总生存期(OS)明显短于低表达患者(P=0.01625)。体外研究显示,抑制BASP1表达后,胃癌细胞迁移

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