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目的观察腹腔镜微创手术治疗小儿先天性胆总管囊肿的疗效。方法选取南海妇幼保健院和广州市妇女儿童医疗中心2015年1月~2017年1月共50例先天性胆总管囊肿患儿作为研究对象,以随机分配为原则,分为观察组和对照组各25例。对照组采用传统手术进行治疗,观察组采用腹腔镜微创手术进行治疗,对比两组患儿的临床疗效。结果观察组患儿平均出血量、排气时间、住院时间、并发症发生率、复发率均低于对照组患儿,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论腹腔镜微创手术治疗小儿先天性胆总管囊肿具有良好的临床疗效,并发症发生率低、复发率低,