如果两个亲本表型相似，则杂交后代产生超亲个体的可能性较大。利用杂种优势、亲缘系数、分子标记可直接鉴定亲本间的遗传多样性。本研究主要是确定７个硬粒红色春小麦材料ＤＮＡ多态性的范围，研究以分子标记为基础的多样性和以亲缘系数为基础的遗传多样性的关系，鉴定遗传多样性与这７个亲本双列杂交下Ｆ１表型的关系。亲本及Ｆ１代播种在３个环境条件不同的点上。对籽粒产量、粒重及蛋白质含量进行了测定。对所有成对亲本组合的亲缘系数进行了计算，利用６３个序列标记点（ＳＴＳ）ＰＣＲ引子簇对各亲本进行检定，并用２７个显示多态性的ＳＴＳＰＣＲ引子簇计算遗传相似性（ＧＳ），同时计算了遗传多态性１—ｒ和１—ＧＳ与Ｆ１表型、中亲杂种优势及ＳＣＡ效应的等级相关．遗传多样性与杂一代表型的唯一显著联系是１－ｒ和粒重ＳＣＡ效应、杂种优势、蛋白质含量杂种优势的联系．遗传多样性与蛋白质含量的杂种优势和ＳＣＡ效应呈相反的关系。多态性测定值１—ｒ和１—ＧＳ与Ｆ１表型相关是同等重要的．亲缘系数和ＧＳ显著相关，且以１—ｒ和１—ＧＳ为基础的聚类分析也得出了相似的结果。没有哪一种多态性分析方法在预测Ｆ１表型方面更优越，而这两种方法在区分不同基因型方面结果相似。