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质粒DNA含有独立复制的遗传结构，是基因工程的常用工具，广泛应用于分子生物学基础研究、农业转基因检测、医疗诊断与基因治疗等领域。质粒DNA的构型一般分为超螺旋、开口环状及线性3种。初步纯化的质粒DNA溶液中常混有3种构型，并且掺杂一定量的蛋白质、RNA、内毒素以及宿主基因组DNA，这些杂质会影响后续的应用，因此质粒DNA需要进一步精细纯化。该文对质粒DNA的新应用领域、基于色谱的精细纯化技术及产物质量分析体系进行了综述，并展望了高纯度质粒DNA精细纯化及产物分析的发展方向。