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转录因子雌激素受体（ER）与核因子κB（NF-κB）的相互作用在多种组织细胞类型中均有研究。ER可在NF-κB信号转导通路的多个环节对NF-κB的转录活性产生影响：影响胞质内的NF-κB抑制蛋白及其激酶复合物：影响NF-κB的核转位；影响NF-κB的DNA结合活性；通过与共调节蛋白相互作用影响NF-κB的活性。二者的相互作用在多种疾病如乳腺癌、绝经及性别相关的免疫性疾病、绝经后骨质疏松等的发生发展中有重要意义。