在我们的气相色谱分析工作中，一般均利用保留值作为定性的依据，但是在实际的分析工作中影响保留值重复性的因素很多。
　　1、 死时间的影响：在气相色谱中测定死时间（或死体积）时，通常用空气中的氮（N2）（在使用TCD检测器时）或甲烷（CH4）（在使用FID检测器时）作为惰性物质，认为它们没有保留，通过测定它们的保留时间，就可以得到死时间，再通过载气流速，就可以计算出死体积但实际上N2和CH4在固定液上都会有一定的溶解度。按文献报道，N2在角鲨烷固定液上的溶解度在100℃时为0.15mL/g，CH4在角鲨烷固定液上的分配系数在70℃时为0.16。因此，即使是用N2和CH4来测定死时间（或死体积），也都会产生一定的误差，特别是对一些保留值较小的化合物，在计算相对保留值或保留指数时引入的相对误差就较大了，从而影响了定性分析的准确度。
　　2、 载体吸附作用的影响：载体的吸附性因不同的厂家和不同的生产工艺而不同，由于载体的吸附性不同，即使固定液相同，溶质的保留指数亦会不同。在气-液色谱中，假定载体是完全惰性的，但实际上载体还是有一定的吸附能力。由于载体不可能完全被固定液所覆盖，仍有极少量载体暴露在气相中，并对溶质有一定的吸附作用。不同的载体吸附能力不同，造成了同一溶质，同一固定液，用不同载体时的保留值有所不同。
　　3、 进样量的影响：要想使保留时间准确，进样量一定要适当。由于载体的吸附作用，进样量过小，会使保留时间滞后，进样量过大会影响柱效和引起峰形不对称。当载体的吸附作用可以忽略时，对称峰的保留值与进样量无关，而非对称峰的保留值与进样量有关。此时拖尾峰保留值随进样量增加而增加；伸舌峰保留值随进样量增加而减小。为了精确定义保留值，则需把进样量外延至零时的保留值作为标准，以消除进样量多少对保留值的影响。当载体吸附作用不可忽略时，由于载体的吸附作用使进样量过小时保留值拖后，也影响保留值的准确测定，此时进样量要适当。在实际工作中可用实验方法寻求合适的进样量，具体方法是：将进样量由小逐渐增大，直至保留时间不再提前，保持恒定值，这就是排除了载体吸附作用的最小进样量，也是准确测定保留值的适宜进样量。
　　4.载气纯度的影响：气中的水分和氧等杂质亦能影响保留值的准确测定。
　　5.固定液纯度的影响：由于生产固定液的厂家、原料、生产工艺和精制方法不同，故不同厂家生产的同一型号的固定液或同一厂家生产的不同批号固定液中的杂质含量往往不同，因而影响保留值的重复性。
　　6. 其他操作参数的影响：除上述一些因素对保留值测定的准确性有影响外，其他色谱操作参数，如：载气流速的稳定性，柱温的稳定性，保留时间的测量方法的准确性等也会不同程度影响保留值测量的准确性。因此对这些操作参数要严格控制，控制越严格，这些参数的稳定性越好，保留值测定的准确性和重复性越好。