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[目的]对杂交鳜(Siniperca chuatsi×Siniperca scherzeri)进行遗传多样性分析并筛选出与生长性状相关的微卫星位点.[方法]选用15个具有较高多态性的微卫星标记,采用PopGene 3.2软件对96尾杂交鳜群体遗传多样性分析,利用卡方检验估计群体的Hardy-Weinberg平衡偏离,采用一般线性模型(GLM)的最小二乘法对微卫星位点与杂交鳜主要生长性状的相关性进行分析.[结果]15个位点共检测出190个等位基因(Na),各位点的等位基因数为3～22个,有效等位基因数(Ne)为1.417 7～10.326 1,观测杂合度(Ho)为0.260 4～0.914 2,平均值为0.601 4,期望杂合度(He)为0.296 2～0.914 2,平均值为0.742 3,各位点的多态信息含量(PIC)在0.279 5～0.903 2之间,均值为0.717 7.15个位点中仅2个位点未显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05).CD90、MDJ821、PY21、PY55和72217这5个微卫星位点分别与体长、体重和体高这3种生长性状显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)相关.[结论]微卫星位点中的等位基因在整个群体中分布均匀,多态性较高,且72217位点中含有的片段为219bp的基因型可作为杂交鳜分子标记辅助育种的重要参考位点.