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目的
采用生物信息学方法预测has-miR-26b、has-miR-1972、has-miR-4485、has-miR-4498和has-miR-4743的靶基因,并分析其所参与的生物学过程及信号通路,为后续功能研究提供理论依据。
方法应用TargetScan、miRBD及DIANA-microT-CDS预测上述5个miRNA的靶基因,各个miRNA的预测结果分别取交集后,再取其合集,应用FunNet进行功能富集分析和信号通路富集分析。
结果用3个在线数据库得到5个miRNA的靶基因的合集为734个;靶基因所涉及的生物学过程广泛,包括多项与中枢神经系统相关的条目,如皮层发育、轴突导向和延伸、突触传递以及学习和记忆过程等(P<0.05);所涉及的信号通路包括轴突导向、谷氨酸能突触、Wnt信号通路、ErbB信号通路、mTOR信号通路、VEGF信号通路等与重症抑郁障碍存在密切联系;has-miR-26b、has-miR-1972、has-miR-4498等3个miRNA在重症抑郁障碍中可能起着更加重要的作用。
结论has-miR-26b、has-miR-1972、has-miR-4485、has-miR-4498和has-miR-4743可能与重症抑郁障碍的发病机制密切相关。