[目的]水土资源可持续利用是经济社会和生态环境可持续发展的基础.以疏勒河、 黑河、 石羊河、 黄河上游、 嘉陵江5个流域为评价单元,研究2001—2016年甘肃省的流域农业水土资源配置效率的趋势、 分析其主要影响因素,并基于不同流域农业生产投入及其冗余状况对生产效率提升途径进行探索.[方法]运用数据包络分析法中的BCC和CCR模型分析该省农业水土资源匹配特征,并利用Mann-Kendall法进行趋势检验,最后运用主成分分析法探究其主要影响因素.[结果](1)2001—2016年甘肃省农业水土资源利用综合效率、 技术效率、 规模效率总体走向呈现上升并趋于稳定,这种上升趋势通过了0.05的显著性检验;(2)从时间序列来看,2001—2016年甘肃省及各流域地区的农业水土资源匹配程度总体上呈现上升趋势并趋于稳定状态;从流域空间上来看,各流域农业水土资源匹配程度比较结果为:黑河>石羊河>黄河上游>疏勒河>嘉陵江;(3)总人口数、 城镇化率、 降水量、 产水模数及GDP耗水量这5个影响因子的显著性和代表性增强,对甘肃省水土资源匹配的解释程度也较强.[结论]甘肃省水土资源匹配度有较大的提升空间,从各流域水土资源利用和管理特点出发,采取具体措施优化限制因子,可以促进区域比较优势的发挥,又能够引导区域农业经济空间的合理化,最终实现农业可持续发展目标.