白念珠菌β-葡聚糖对单核/巨噬细胞mRNA、lncRNA与miRNA表达谱的影响及miR-210调控机制的研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:eyx001
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研究背景:白念珠菌(Candida albicans,C.albica)ns是一种寄生于人体皮肤及粘膜的机会致病菌。白念珠菌通常是无害的,免疫系统可以有效的抵御它的入侵,然而,对于免疫抑制患者,白念珠菌是致病菌。随着免疫抑制人群的增加,超过一半的浅表和系统性念珠菌病是由白念珠菌引起。因为白念珠菌的真核属性和对治疗药物的抵抗,增加了治疗的难度。为了开发针对更多特异治疗靶点的药物,需要深入的研究白念珠菌的发病机制。固有免疫是抵御白念珠菌感染的第一道防线,固有免疫细胞包括单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞等。大约60%的白念珠菌细胞壁成分是β-葡聚糖,C型植物凝集素-1(dendritic cell-associated C-type lectin-1,dectin-1)可通过脾酪氨酸激酶和胱冬肽酶募集结构域9(Syk-CARD9)依赖的方式激活NF-kappa B(NF-κB)和p38 MAPK信号通路,从而介导固有免疫反应。非编码RNA包括长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与microRNA(miRNAs)等,lncRNA在很多疾病进程中发挥重要作用,但在白念珠菌感染中的作用只有少量的报道。本课题组前期使用白念珠菌细胞壁不溶性β-葡聚糖(insoluble β-glucan from the cell wall of C.albicans,CaIG)体外诱导THP-1 巨噬样细胞后,发现miR-210、miR-146a与miR-30表达上调,miR-210在白念珠菌感染的固有免疫中的作用尚不明确。研究目的:1.研究CaIG诱导CD14+单核细胞与THP-1巨噬样细胞后,mRNA与lncRNA表达谱的改变。2.研究miR-210调控CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞dectin-1激活的炎症反应的机制。研究方法:1.使用CaIG诱导健康人原代CD14+单核细胞与THP-1巨噬样细胞后,RNA测序法检测差异表达的(differentially expressed,DE)mRNAs 与 lncRNAs。2.对两组共同DE mRNAs做GO与KEGG分析,分析DE基因的基因功能与白念珠菌感染固有免疫中可能启动的信号通路。3.lncRNA-mRNA共表达分析,初步预测lncRNAs的调控谱。4.生物信息学方法预测CaIG诱导THP-1巨噬样细胞后DE miRNAs的靶基因,并对靶基因做GO分析。5.使用针对miRNA-210特异的mimic与inhibitor转染方法,研究miR-210调控CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞的炎症反应的机制。研究结果:1.与对照组相比,CaIG诱导的CD14+单核细胞总共发现10788个DE mRNAs,2021 个 DE lncRNAs。THP-1 细胞组共发现 3349 个 DE mRNAs,291 个 DE lncRNAs。两组取交集发现808个mRNAs重合,51个lncRNAs重合。qRT-PCR法在两组细胞内检测了 5个共同DE mRNAs与lncRNAs,验证了 RNA-seq结果的可信性。2.GO与KEGG信号通路富集分析发现共同差异的808个mRNAs分别最显著富集于inflammatory response(炎症反应)与NF-κB信号通路。3.将51个lncRNA与808个mRNA做lncRNA-mRNA共表达分析(PCC绝对值>0.99,p<0.001),两组结果取交集后发现8个lncRNAs与60个mRNAs之间的97对共表达,共表达分析推测lnc-CCL3L3-1:1在CaIG诱导的单核/巨噬细胞的固有免疫反应中可能参与调控NF-κB信号通路。4.对miRNA-146a、miRNA-210与miRNA-30的靶基因做GO分析,靶基因最显著富集于nucleus(细胞核)。5.CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞miR-210表达量上调呈时间依赖性,在24小时表达量达到峰值。MiR-210下调了 CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞炎症因子TNF-a与IL-6的表达与分泌。MiR-210抑制了 CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞信号分子Syk与IκBa的激活以及p65核转移。结论:1.LncRNA可能参与了白念珠菌感染的固有免疫反应。2.CaIG诱导的miRNA-210作为一个负反馈调节因子,通过下调Syk-NF-κB信号通路的激活,参与了CaIG诱导的THP-1巨噬样细胞dectin-1激活的炎症反应。
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