质谱分析HepG2细胞中Gab2的结合蛋白

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脂肪肝,是慢性肝脏疾病和代谢性障碍发生的最常见原因,已经严重影响到全球人类的身体健康。脂肪肝会从最开始的脂肪变性,到脂肪性肝炎,肝硬化、肝细胞癌以及多种肝外并发症(心血管疾病、其他器官的恶性肿瘤)。Gab2作为信号平台蛋白,介导复杂的蛋白-蛋白相互作用。本实验室前期研究证实油酸和酒精能够诱导Gab2表达增加,并促进Gab2募集PI3K、Shp2或Socs3以及激活它们的下游信号如Akt、Erk和Stat3。故此,Gab2是肝脏疾病的重要相关蛋白,是致病因子诱导脂肪肝的信号整合枢纽。但人们对Gab2具体是如何整合多种信号从而调控脂肪肝的依然知之甚少。本课题进行了3次基于亲和纯化的定性质谱有效实验,分别鉴定到了 621、780、537个蛋白,重复出现的蛋白有408个。这些蛋白中包含23个已知的互作蛋白,以及385个新发现的Gab2结合蛋白。通过STRING和Metascape软件对这些蛋白进行相互作用网络分析和通路富集热图分析,可知这些蛋白除了参与细胞周期调控、细胞定位、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号等,还参与了甘油磷脂的生物合成、乳酸合成和代谢、上皮细胞信号传导等,而这些代谢信号与脂肪的积累和脂肪肝的发展密切相关,提示Gab2作为平台蛋白,确实介导众多相关蛋白参与到对脂肪肝的调控中来。本课题还利用了多维质谱联用技术和细胞稳定同位素氨基酸标记技术,系统分析和揭示了 Gab2结合的重要相关蛋白的动态定量变化。油酸诱导的定量质谱实验鉴定到了 153个蛋白,其中增加2倍以上的蛋白有15个。而酒精诱导的定量质谱实验鉴定到了 175个蛋白,其中增加2倍以上的蛋白有20个。通过String软件对这些蛋白进行蛋白-蛋白相互作用分析,可以发现这些蛋白大多数与Gab2蛋白有着直接的相互作用。本课题创新性地利用基于质谱的蛋白组学,首次全面、系统地建立了 Gab2结合蛋白的相互作用网络;揭示了 Gab2的重要相互作用蛋白在脂肪肝模型中的动态变化,有望为脂肪肝预防和治疗的新药物开发提供重要的科学依据。
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