水稻细菌性褐条病原的鉴定、全基因组和致病相关基因的研究

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近年来,在国内不少地方相继爆发了水稻细菌性褐条病。为明确该病原,从而为有效防控提供理论基础,本文在实验室前期的研究基础上,对采自浙江富阳市的水稻细菌性褐条病样本进行分离,利用电镜、Biolog、FAMEs、16S rDNA Phylogeny等技术,从生理生化到分子生物学水平上对病原进行了系统鉴定,病原细菌为Acidovorax avenae subsp. avenae.由于该病菌与我国另一种重要的瓜果病害-西瓜果斑病菌(Acidovorax avenae subsp. citrulli)亲缘关系非常近,因此在国内外首次对该病菌的全基因组进行了测序。根据Reference序列和SOAPdenovo、GapCloser等软件对测序结果进行了拼接、组装和注释,对contigs内部残缺的序列也进行了补充,完成了该病原菌基因组的精细图,并对该基因组的特征进行了初步分析。最后还尝试利用Tn-5转座子系统构建了该病原细菌的突变体库,筛选到了两株致病力减弱的突变体。我们利用染色体步移技术对这两株突变体进行了转座子定位,明确了插入位点及被破坏的基因分别为fadD和pliO.
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