农业资源是人类赖以生存和发展的必要条件和物质基础,新疆是一个农业大省,农业经济的发展水平在很大程度上影响着整个新疆国民经济的发展水平,虽然农业资源存量丰富,但可利用的农业资源数量十分有限,因此,如何合理、有效地利用有限的农业资源,提高农业资源的配置效率是新疆农业发展的重要课题。近年来,新疆的主要农产品产量和质量都有了大幅度的提高,农、林、牧、渔及种植业内部的结构都发生了巨大变化,市场在引导农业资源优化配置中发生日益重要的作用。然而,农业资源配置效率在近年来呈现什么样的特点,是不是也在逐步提高呢?它们又呈现出什么样的地域特征呢?农业生产要素配置的技术效率、规模效率又呈现出什么样的特征呢?只有很好的回答了这些问题,我们才能采取相应的措施,进而提高新疆农业生产率。本文采用数据包络分析(DEA)方法,对新疆各县市农业资源配置效率进行了实证分析,数据结果表明,农业资源配置效率总体来说还是比较高的,从时间序列上其呈现出先下降再升高的特点,这主要是政府近年来加大对农业的投入力度,正是由于这些投入具有一定的滞后性才导致资源配置效率呈现这样的特点;从新疆各区域上其呈现出不规则的特点,这主要是由于现行的农业产业结构、投入农业生产要素的组合已经使农业资源配置达到很高一个水平,如果不适时进行产业结构升级换代和农业生产要素组合的优化,那么,资源配置效率还会出现相对下降趋势。因此,进行农业产业结构和生产要素组合优化,是目前新疆农业面临的主要任务。