古菌属于生命三域之一的古菌域常被发现于各种极端自然环境中,古菌是有待开发的微生物资源。嗜盐古菌是高盐环境（如盐湖和日晒盐场等）中的优势菌群,参与多种物质的循环与能量传递,是高盐生态系统的重要组成部分。与细菌相比,古菌在水生动物食物链中的作用并不清楚。本论文针对三株古菌Haloarcula、Haloferax和Halorubrum,采用悉生实验系统,探讨不同盐度下（30,100和150）三株古菌能否作为卤虫唯一饵料,并比较其作为饵料对卤虫存活、生长和对鳗弧菌（Vbrio anguillarum）感染抵抗力的影响。利用“卤虫-古菌”悉生实验系统,证实了 3株嗜盐古菌均可作为卤虫的唯一饵料,为卤虫提供营养促进其生长;利用“卤虫-古菌-致病菌”攻毒实验系统,证实3株嗜盐古菌均可增强卤虫抗V.anguillarum感染能力。为进一步探究古菌在卤虫食物链中的作用,在开放养殖系统中,通过添加碳源、调节C/N和接种古菌,探讨古菌生物絮团对卤虫生长、水质和生物絮团微生物多样性的影响。分别向养殖水体添加Haloarcula和Halorubrum（106 CFU/mL·d）,以蔗糖为碳源,设置4个不同C/N（0、5、15和30）,进行24天的零换水卤虫养殖。水体盐度为100。结果表明,高C/N（15和30）下,添加蔗糖和Halorubrum可显著提高卤虫的存活率和生物量,并有效降低养殖水体中的氨氮和亚硝酸氮含量（P＜0.05）。高通量测序分析表明,添加古菌Halorubrum和蔗糖（C/N为15）能提高生物絮团微生物多样性和改变属水平上优势菌群。但Halorubrum在生物絮团中生长不佳,并未在生物絮团中形成优势。为使古菌能在生物絮团中生长并形成优势,在养殖水体中接种能在盐度100下良好生长的Haloferax,以蔗糖为碳源,以标准饵料投喂量0、10%、50%和100%四个不同饵料投喂量水平,水体盐度为100,在卤虫养殖前以2×107 CFU/mL向养殖水体添加一次Haloferax,养殖卤虫后每周以107 CFU/mL添加。研究结果表明,在饵料投喂量不足条件下,添加蔗糖和Haloferax能提高卤虫生物量,能显著降低养殖水体中的氨氮水平（P＜0.05,养殖水体中氨氮水平均偏高）,但未能有效降低养殖水中的亚硝酸氮水平。高通量测序分析表明,添加蔗糖和Haloferax虽未能提高生物絮团微生物多样性,但Haloferax能在生物絮团中生长并占有优势。综上所述,悉生实验条件下,三株古菌均可为卤虫的唯一食物并提高其存活、生长和抗V.anguillarum感染力。开放养殖条件下,添加古菌和蔗糖能促进卤虫生长,一定程度上改善养殖水体水质,其中Haloferax可成为生物絮团的优势菌。本研究为古菌在水产养殖业中应用可行性提供基础数据。