目的：通过比较黄芩苷、栀子苷、胆酸治疗中风的靶点网络的网络拓扑属性、模块性、GO富集结果，从网络药理学的层面探索黄芩苷、栀子苷、胆酸治疗中风的药理作用机制及异同，探索利用网络药理学研究中医药的方法。　　方法：基于Pubchem数据库，用黄芩苷、栀子苷、胆酸的药效学相关信息干预前期研究中构建的来源于OMIM数据库中风疾病网络，应用Cytoscap软件将相关基因—蛋白质映射到中风疾病网络中整合对比，进行网络拓扑属性分析与模块化分析，并通过超几何分布检验统计进行GO功能富集分析比较模块功能。　　结果：检索PubChem Compound发现与黄芩苷相关的基因10个，与栀子苷相关的基因一个，与胆酸相关的基因9个。分别构建了包含1120个节点，3928条边的黄芩苷-中风网络；1071个节点，3679条边栀子苷-中风网络；1095个节点，3760条边胆酸-中风网络。网络拓扑属性分析发现三个网络是无尺度网络。黄芩苷-中风网络划分为72个模块，栀子苷-中风网络中识别出82个模块，胆酸-中风网络中识别出83个模块。比较三个网络的模块的GO功能富集分析结果与中风网络的模块的GO功能富集分析结果发现，有9个与中风相关的生物学过程被黄芩苷所抑制，两个生物学过程被栀子苷所抑制，12个生物学过程被胆酸所抑制，9个生物学过程被胆酸所激活。　　结论：黄芩苷治疗中风的主要途径是抑制白三烯的合成及白细胞毒作用，抑制单核细胞增殖和肿瘤坏死因子的产生，抑制细胞凋亡，调节蛋白质和不饱和脂肪酸的代谢等。栀子苷治疗中风的主要途径是抑制通过肾素-血管紧张素调节全身动脉血压和白细胞趋化。胆酸治疗中风的主要途径主要是抑制细胞形态分化及细胞外渗，抑制胆固醇的运输、储存，调节激素分泌，抑制细胞因子介导的信号通路，抑制含氮化合物的代谢过程，激活细胞表面受体的联系信号转导、中性粒细胞趋化、内皮细胞迁移，激活双氧水应答和血浆脂蛋白颗粒重塑等。