诺卡菌多重PCR及Real-time PCR检测方法的建立

被引量 : 0次 | 上传用户:mu_322
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
诺卡菌是一种机会致病菌,它引起的诺卡菌病可发生于许多人种、职业、年龄,主要引起肺部、皮肤感染以及急性或慢性化脓性或肉芽肿性病变,有时会侵袭脑部,形成脓肿,严重时甚至能够引起病人的死亡。研究人员通过大量的调查研究发现,诺卡菌感染病例正在逐年增加。诺卡菌的常规鉴定方法是分离培养,需要花费大量的时间和人力,通常需要一至三周完成。随着分子生物学的发展,诺卡菌的PCR检测方法也得到了发展。多重PCR和Taqman探针Realtime PCR方法具有特异性好、灵敏度高,自动化程度高、速度快等优点,被广泛应用于微生物学检测。将这两种方法应用到诺卡菌的检测中,为快速分离和临床诊断诺卡氏菌提供一定的参考依据。目的本研究拟建立诺卡菌多重PCR及TaqMan Real-time PCR的检测方法,为临床快速、准确鉴别诊断诺卡菌提供可靠的参考标准。方法1以诺卡菌的16SrRNA、rpoB、SecA1为靶基因,设计这三个基因的特异引物,用诺卡菌标准株DSM43003、临床株CDC51的DNA为模板做单重PCR实验验证引物的特异性。在单重PCR反应的基础上优化多重PCR方法的反应条件和反应体系,同时对44株诺卡菌标准株、44株临床分离株和7株非诺卡氏菌株进行扩增,检验该方法的灵敏度、特异度和实用性。2基于诺卡菌rpoB基因设计TaqMan荧光定量PCR特异的引物与探针,提取鼻疽诺卡菌标准菌株DSM43003的DNA,扩增rpoB基因并纯化PCR产物,连接pMD-18T载体,导入JM109感受态细胞,筛选阳性克隆子并提取质粒,10×倍比稀释所得质粒,制作标准曲线确定所建立方法的检测下限;用29其他致病菌验证引物和探针的特异性;使用痰液模拟标本验证该方法的实际应用性。结果1利用单对引物对其中2株诺卡菌(DSM43003、CDC51)进行扩增,出现的条带均为与目的片段长度一致的单一条带,经测序并经BLAST验证扩增的片段为目的基因。建立的多重PCR方法,44株诺卡菌标准株中有43株(97.7%)、44株临床分离株中有42株(95.5%)3条片段都显示,7珠对照菌株均未显示条带。2建立诺卡菌TaqMan荧光定量PCR方法的标准曲线,确定该方法可以检测到23copy/反应管目的基因,痰液模拟标本检测2.0×102cfu/ml的细菌含量即可被检出;特异性实验中,只有诺卡菌有明显的S型扩增,且荧光信号强,其他菌株未见特异性扩增。结论1.研究建立的多重PCR、Taqman探针Real-time PCR能够快速、准确地鉴别诺卡菌,12小时内能完成对诺卡菌的检测,灵敏度高,特异性强,能够为快速鉴别诊断诺卡菌提供可靠的参考依据。2.多重PCR、Taqman探针Real-time PCR两种方法相对比,多重PCR的成本较低,且实验操作简单易掌握;而Taqman Real-time PCR能够绝对定量地鉴别诺卡菌,灵敏度、特异度更好,敏感性也更强,2.0×102cfu/ml的诺卡菌即可被检出。
其他文献
公民一词很早就出现在古代的西方社会,公民教育也伴随着公民的出现而诞生。公民有一定的历史范畴,我国的公民教育出现在晚清时期,民国时期有一定的发展,改革开放以后得以重现。随
现阶段,对于已经进入高含水期的油田提高采收率最常用的方法是采用聚合物驱油技术,与此同时,油田上对于高浓度聚驱技术的研究已取得突破性的进展,并且取得较好的效果。虽然采用高
企业风险管理已经成为公司经营和发展不可或缺的重要组成部分。特别是度过2008年全球金融危机,进入后危机时代,越来越多的公司开始致力于充分发挥企业风险管理对公司运营的积极
一般论述中,较少将莎士比亚与"革命"牵扯在一起,而习惯地将之纳入"抒情"的传统。本文以1937年上海业余实验剧团的演出《罗密欧与朱丽叶》为例,论述导演章泯是如何在特殊的历
实验记录单是科学实验必不可少的元素之一,在小学生的科学学习过程中记录单起着举足轻重的作用,但很多小学教师却忽视了实验记录单的作用,在科学课上并没有充分利用记录单。
入境旅游流研究和旅游目的地研究一直是旅游学研究的重要内容,国内外学者在入境旅游流研究和目的地研究方面都已取得比较丰硕的成果。随着国内旅游市场和出境旅游市场的不断
LW水厂项目由郑州自来水投资控股有限公司承建,是郑州市十二五期间的重点供水工程,项目总投资将近十亿元,利用南水北调优质水源,设计日供水能力为40万吨。该项目作为市政工程
摘要:传统分子生物学着重于研究单个基因功能,但生物体是一个复杂的系统,基因间彼此相互作用形成网络,基因网络的功能并不简单的是单个基因功能之和。因此在后基因组时代,功能
羽毛球、乒乓球、网球属于竞技项目中的技能主导类、持拍隔网对抗项群,乒乓球和羽毛球是我国的优势项目。目前,网球相对于同项群运动项目更易于向优势项目转移的项目。通过观看
在近几年的发展过程中,我国的网络技术以及计算机技术都获得了长远的发展,媒体在发展的过程中也有了一定的改变,新媒体在现阶段的发展过程中逐渐发展成熟,并推动了中国社会成