新冠疫情给医药制造业带来了新的挑战:研制新冠疫苗。新型药品的研制需要技术创新的支持,企业只有不断进行创新,才能在不断变化的整体局势下生存和成长。医药制造业属于知识技术密集型产业,需要高水平的知识和专业技术才能推动其发展,创新发展过程中需要研发投入资金的支持。但是由于医药制造业的研发创新活动的周期长、风险高,难以引进外部投资,因此本文认为可以通过政府补助帮助医药制造企业解决现金流短缺的困境,提升企业开展研发创新活动的积极性,提高企业创新绩效。同时政府补助还能吸引外部资金的注入,缓解企业的资金压力和财务风险,提高企业的研发创新效率,进而提升企业创新绩效,有利于医药制造业企业的长期可持续发展。本文以我国医药制造业企业沪深上市公司为研究对象,研究方法选择文献研究法、定性分析法、实证分析法和比较分析法,以技术创新理论、信息不对称、信号传递理论和外部性理论作为理论基础,在国泰安数据库和WIND数据库中搜集医药制药业企业上市公司的财务数据和专利数据,最终选取沪深A股市场中2007-2019年217家医药制造业的相关指标数据,对医药制药业企业整体资产规模、政府补助与政府补助强度、研发投入与研发投入强度和创新绩效的发展现状进行了梳理和分析,发现存在政府补助、研发投入增长率下降等问题。本文通过构建实证模型,研究了医药制造业政府补助对创新绩效的影响,以及研发投入在二者中的中介效应。在实证研究过程中,创新绩效的指标选择为专利申请总数,采用政府补助强度来衡量政府补助,以研发投入强度来衡量企业研发投入情况,选取净资产收益率、资产负债率和有形资产比率等指标作为控制变量。采用回归分析法对研究假设进行验证。在实证研究的进一步分析中对样本企业进行了异质性分组分析。按企业性质分为国有企业和非国有企业,按企业规模分为大规模企业和小规模企业,按企业所处地区分为中西部地区企业和东部地区企业,探讨研发投入在二者之间中介效应的差异。研究结果表明:（1）医药制造业企业的政府补助、研发投入与创新绩效均具有正向促进作用（2）研发投入在政府补助和创新绩效的关系中存在部分中介效应（3）研发投入的中介效应只在非国有控股的企业中存在,而在国有控股的企业中并不存在;政府补助对于企业创新绩效的促进作用对小规模的企业效果更好,且研发投入的中介效应也仅存在于小规模的企业之中;政府补助对于企业创新绩效的促进作用,以及研发投入在政府补助和创新绩效中的部分中介效应均仅仅在东部地区存在,而在中西部地区并不显著。通过滞后效应检验、指标替换检验和Sobel-Goodman中介效应检验对实证结果进行稳健性检验,前文结论仍然成立。本文研究有助于医药制造业企业了解行业的创新发展现状,认识政府补助对创新绩效的影响,理解研发投入在企业创新活动中发挥的中介效应。研究结论为医药制造业企业提高创新效率、为政府完善相关政府补助政策提供理论指导。