民营高科技企业作为我国非公有制经济的一个重要组成部分，为我国的经济发展做出了重要的贡献。目前它正处在蓬勃发展的时期，很多民营高科技企业已经意识到了对部门实施绩效管理的必要性，也采取了相应的绩效管理措施，当然也取得了一定的效果，但是这种效果并不尽如人意。追求简单，最后往往流于形式；追求科学化、理论化，导致投入了大量的人力、财力，效果却不够理想，甚至带来负面影响。 本文针对目前民营高科技企业实施部门绩效管理存在的问题，提出了采用以目标为导向的部门绩效管理方法，对此方法进行了详细的阐述，并对关键部门如何实施此方法进行了具体指导。以目标为导向的部门绩效管理方法将绩效管理和目标管理结合起来，把绩效管理和绩效发展结合起来，把绩效发展与目标管理结合起来，把部门目标与企业目标结合起来，构建了一个新的绩效管理的原则和工作标准体系，从而更有利于最大化地实现企业目标。以目标为导向的部门绩效管理方法为民营高科技企业部门绩效管理工作提供了一个崭新的途径和方法。