通过碱基对的非对称性比较来探测分子序列替换模型的异质性

来源 :西南农业大学 西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zjzjzj13
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在该论文研究中,对于一对序列进化模型的可观察到的不同,我们提出了一个相对简单的方法,来检测在DNA序列间替代过程的同质性.这个方法是非常简单的,只要序列可以对准(alignment),就可以非常容易地运用它.我们在各种不同的生物学条件下检查了这个检测的效能,发展了一个Monte Carlo方法来检测观察到模型的同质性,并通过计算机模拟和真实数据的分析,比较我们的卡方检测与Kumar and Gadagkar的I<,D>检测之间的效能差异.这个测验可作为一个诊断工具来鉴别基因和世系,而这些基因和世系用广泛不同的进化过程来反映观察到的模型变化.且在比较基因组学和分子系统发生学研究中,对这些基因和世系的鉴别是发现已经形成的生物体基因组进化过程的一个重要前期步骤.一般而言,卡方检测作为一个工具在筛选非典型变化模型的基因和世系的进化是很有用的.
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