应用SNP芯片技术探索早孕期自然流产的遗传学因素

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目的:  应用单核苷酸多态性芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)技术分析早孕期自然流产胎儿染色体异常的发生率和特点,为自然流产患者的遗传咨询和进一步的生育指导提供重要依据。  方法:  选取2016年11月至2017年7月在郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心就诊的520例临床确诊的早孕期自然流产患者,孕妇年龄为17~49岁,平均29.8岁,孕周为4~13+4周,平均9.5周。应用Illumina Human cyto12芯片对胎儿绒毛组织进行全基因的拷贝数分析。  结果:  在520例流产物标本中,有510例成功进行了SNP芯片分析,检测成功率为98.1%,其中异常结果占57.6% (294/510),正常结果占38.8% (198/510),良性拷贝数变异(copy number variations,CNV)占2.4% (12/510),临床意义不明性变异(variants of uncertain significance,VOUS)占1.2% (6/510)。异常结果中非整倍体占75.2%(221/294),多倍体占13.9% (41/294),致病性CNV占8.2%(24/294),单亲二体(uniparental disomy,UPD)占2.7% (8/294)。非整倍体中以X-单体最常见,其次为16-三体,第三是22-三体。多倍体中以69,XXY核型最常见。当孕妇年龄超过35岁之后胎儿非整倍体的发生率明显升高,而多倍体的发生率与孕妇年龄无关。孕10~11周流产的胎儿非整倍体异常的发生率最高,而多倍体的发生率与流产孕周无明显关系。  结论:  染色体异常是导致胚胎早孕期流产的最主要原因,其中以非整倍体最常见,非整倍体中以X-单体最常见,其次为16-三体,第三是22-三体。当孕妇超过35岁后胎儿非整倍体异常的发生率明显升高,而胎儿多倍体异常的发生率与孕妇年龄无关。存在非整倍体异常的胎儿更容易于妊娠10~11周流产,而存在多倍体异常的胎儿未见明显的流产孕周。SNP 芯片技术具有成功率高、分辨率高、准确性高、快速等优点,可以为自然流产病因的探索提供一种更好的遗传学检测手段,但对一些少见的微缺失/微重复的判读和解释也为临床遗传咨询带来了一定困扰。
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