南水北调工程是二十一世纪我国十分重要的水利工程之一，其核心目的即解决我国北旱南涝的水资源分配不均匀问题，整个工程分为西线、中线和东线三个工程。其中中线是最为重要的一部分，源自陕南的丹江和汉江，其中丹江口水库是中线工程的水源地所在。但随着中线工程送水作业的不断进行，在丹江口地区则是逐渐发生了一些水土流失问题，同时在水质上也出现了显著的降低情况，对当地的生态环境和人民生活均造成一定影响。水资源作为生态资源的一类，具有十分典型的公共品属性以及外部性属性，而目前在丹江口水库的水资源开发上则是因为在既有补偿机制上存在的缺陷，导致水资源供给者和受益者之间的经济利益分配存在不合理之处，对于水源地的发展而言存在一些不公平之处。
　　鉴于此，本文以南水北调中线工程水源地生态保护为研究方向，重点就其中的生态保护机制进行探究。本文首先对研究的背景、意义以及国内外在该领域的既有研究成果进行综述，并简要概述本研究的主要研究内容，介绍本研究拟采用的研究方法和技术路线，然后对水源地生态保护机制的相关理论进行概述。本文分别对生态补偿的概念及原则、生态补偿的方法及计算标准进行了阐释。还指出了进行生态保护的理论资源包括马克思劳动理论及外部性理论、自然资源价值论及产权理论，特别强调了马克思主义的生态思想是进行生态保护的重要思想资源，需要用人与自然和谐共存的理念推动南水北调中线工程水源地的生态保护。
　　在对生态保护的相关理论进行论述后，还对南水北调中线工程水源地生态补偿需求进行分析。从社会经济、自然条件两个部分对南水北调中线工程水源地概况进行了分析，确定了补偿主客体，补偿量，确定了补偿分担模式。
　　在以上基础上，本文试图建构南水北调中线工程水源地生态保护机制。首先从横向补偿机制、纵向补偿机制两个方面，完成政府部门方面的补偿机制建设，然后从确定水权、市场运行机制、价格形成机制三个部分出发完成市场补偿机制的建构。