通过总结和分析我国口岸管理体制沿革、现状和问题,以及实地调查和文献研究,本文对粤东口岸管理体制进行考察,分析粤东口岸管理体制存在的问题,指出在一个经济地理区域形成多个口岸同时共同发展,多个地方政府和多个口岸管理部门之间缺乏有效协作,相互之间进行盲目攀比和重复建设；从粤东口岸管理体制现状来看,现有的职能分散、对外不统一、反应速度慢的管理体制,已经不适应现代贸易便利化的要求。通过公共选择理论这一理论视角对粤东口岸管理体制困境背后的政府行为进行分析。公共选择理论通过个人主义方法论、理性“经济人”的人性假设和经济学的交换模式去分析政治决策过程,认为政府和市场一样,本身也存在着难以克服的弱点和缺陷,也有可能失灵。而粤东口岸管理体制的困境,折射出粤东口岸管理中缺乏长期规划的理性的管理办法,个体的理性选择行为导致集体的非理性结果。政府干预不仅未能弥补市场机制的缺陷,甚至会使社会资源的配置更无效率。政府干预和企业的寻租行为会导致大量的“低技术重复开发”,甚至出现了“劣币驱逐良币”的现象。本文的核心观点是,粤东口岸管理体制改革需要正确看待政府经济人这一角色,从制度规范、领导体制和运行机制三个层面,通过完善法规法规设计、改革通关模式、加强信息披露、防止政府不当干预经济、完善科学决策等方法,合理规避政府在口岸管理中的逐利行为,从而推动粤东口岸管理体制健康有序发展。