基于生物信息学的子宫内膜癌诊断标志物的筛选及免疫细胞浸润分析

来源 :中国免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hdazf

【摘要】

：

目的:筛选子宫内膜癌(EC)的诊断生物标志物,并分析EC中免疫细胞浸润情况。方法:从GEO和TCGA数据库下载EC的表达谱数据集,利用R软件鉴定EC与正常子宫内膜组织的差异表达基因(D

【作者】

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阿说阿牛孙丽曲木金作伍秋红

【机构】

：

凉山州妇幼保健计划生育服务中心妇产科

【出处】

：

中国免疫学杂志

【发表日期】

：

2020年22期

【关键词】

：

子宫内膜癌诊断标志物免疫细胞浸润分子机制 Endometrial cancer Diagnostic marker Infiltration of imm

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目的:筛选子宫内膜癌(EC)的诊断生物标志物,并分析EC中免疫细胞浸润情况。方法:从GEO和TCGA数据库下载EC的表达谱数据集,利用R软件鉴定EC与正常子宫内膜组织的差异表达基因(DEGs),对其进行功能和通路富集分析。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选关键(hub)基因,并对hub基因进行ROC分析筛选出EC的诊断生物标志物。利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析EC中免疫细胞浸润情况。结果:共鉴定出448个DEGs和10个hub基因。DEGs主要涉及染色体分离、核分裂等生物学过程

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