中国大陆新型弹道导弹令爱国者-3(PAC-3)陆基防空导弹废弃过时，徒叹奈何。分析人士表示，中国大陆部署速度更快、射程更远的新型再入式远程导弹，加上引进多弹头分导技术，将大大削弱台湾最先进的、购自美国的爱国者-3导弹拦截装置的效力，击穿爱国者3构建的防空网。台当局“国安局长”蔡得胜3月16日表示，中国大陆最近已经开始部署东风-16弹道导弹。他还指出，东风-16射程在800公里至1000公里之间，中国大陆部分该型导弹对准台湾。蔡得胜还表示，中国大陆大多数导弹拥有多弹头，能够击中不同目标，如雷达站和机场上的飞机等。
　　多年来一直密切关注中国大陆导弹库发展动向的一名资深美国专家向《台北时报》表示，尽管有关东风-16的公开介绍少之又少，目前其具体性能参数尚不得而知，但是仅从赋予一个新型号本身就足以说明其与现役导弹有相当大的差异。
　　华盛顿国际评估和战略中心资深研究员费学礼(Rick Fisher)也表示，东风-16“确实存在的可能性很高”。他并强调，东风-16新型导弹系统很可能综合应用了诸如固体火箭燃料、先进制导和弹头设计技术等。他也坦承，此次为其首次听说东风-16型导弹。
　　令人担忧的是，速度更快、射程更远的弹道导弹，如东风-16，将大大削弱台湾爱国者-3导弹拦截装置的效力。台湾不惜重金从美国购得爱国者-3，目前仍正在部署之中。
　　弹道导弹的射程越远，要抵达目标就必须飞得越高；而其飞得越高，降至地面所需时间也就越长；进而使得地心引力获得更多时间为弹头加速。费学礼表示，“所有爱国者-3均尚未实战部署，而现在即使实战部署，也将有可能被飞行速度更快、射程1000公里的东风-16击败。”
　　射程如东风-16的弹道导弹可能将部署在解放军第二炮兵部队驻安徽省第52基地，并对准台湾，以及美军在西太平洋地区的军事基地，如冲绳和关岛等。
　　华盛顿“2049项目研究所”发布的一份研究报告称，第52基地下辖5个短程弹道导弹旅和多达3个中程弹道导弹旅。目前尚不清楚第52基地是否已经新建1个东风-16导弹旅，或者其中1个旅已经使用东风-16导弹替换旧型短程弹道导弹。
　　美国《防务新闻》周刊驻台北办公室主任温德尔明尼克(Wendell Minnick)则对东风-16代表一个新型导弹提出怀疑，他认为东风-16有可能只是现役射程约600公里的东风-15型导弹的射程延长改进型。明尼克强调，“坦率地说，如果东风-16果真已经部署，我认为所有美国分析人士都对此一无所知是不可能的。”明尼克还分析说，“台湾当局有可能试图以此恐吓美国，以促成美方对台军售新型F-16战斗机和潜艇等。”
　　费学礼表示，如今解放军东风-21“航母杀手”导弹拥有多弹头已经众所周知，而中国大陆武器库中的其它小型导弹也拥有分导式再入弹头(MRV)则是一个令人担忧的发展动向。他指出，“爱国者-3仅能应对一枚来袭导弹目标，而非多个分导式再入弹头。”他还透露说，美国最近取消了一次针对分导式再入弹头拦截的导弹防御项目计划。