基于自相关系数和PseAAC的蛋白质结构类预测

来源 :计算机科学与探索 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Lassie01
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
传统的预测方法在构造特征向量时只考虑了氨基酸的组成,而自相关系数不仅能够很好地反映序列中氨基酸的位置信息,而且考虑了序列内部不同位置的氨基酸间的相互影响。设计了一种将氨基酸组成和自相关系数相结合的方法来构造特征向量;在Chou提出的伪氨基酸组成模型(pseudo.aminoacidcomposition,PseAAC)的基础上,通过扩展信息重新构造了伪氨基酸组成模型,并将其与自相关系数组合在一起来构造特征向量。分别使用两种方法编码,选用支持向量机作为预测工具,在数据集Z277、Z498以及独立测试集D13
其他文献
针对人工蜂群算法自身存在的局部搜索能力较差,收敛较慢,易受到局部最优束缚的问题,在种群搜索过程中引入梯度信息,并利用中心差分格式对梯度做近似处理,提出了一种基于种群的梯度
棉花柱头外露种质在不同年份、不同播期和不同日照长度下种植,使其处在不同的光温特别是在不同的温度条件下发育,造成棉花现蕾期的变化。根据种质营养生长期天数、感温指数和对
随着科学技术的飞速发展,计量技术机构信息化工作的重要性越来越突出。规范的计量检测业务流程,能将计量机构的各个业务环节有效地联系在一起。鉴于此,设计了计量检测业务系
工程名称:弘阳旭日上城工程位置:浦口大桥北路69号工程概况:弘阳旭日上城位于南京市大桥北岸,毗临长江,地处弘阳板块中心区内,拥有数十条公交线路,过江通道、地铁等一应俱全.工
目的:研究小鼠负重游泳导致疲劳过程中血清代谢模式改变,为营养抗疲劳研究提供依据。方法:雄性昆明小鼠,随机分为4组,以AIN-93饲料喂养14 d,分别接受0(正常对照)、30、601、20 mi
制备了一种竹屑粉脲醛树脂(UF)基复合材料,并对其性能特点进行了研究;介绍了UF基竹屑粉复合材料的制备方法.实验指出:竹屑粉UF基复合材料中的竹屑粉含量和粒度对性能有明显的
使用基于面积特征和形状特征的矩形算法可以从卫星图像中分离出民居目标,对于误识别疑似民居区域,需要进一步提取它们的纹理特征加以排除。并且需要设计旋转、放大和裁剪算子,对所有抽取目标进行大小和方向的标准化。弹性网格技术可以选取图像的多个特征行和特征列,而它们的相交把一个图像划分成多个特征子格。计算出每个子格的灰度共生矩阵(gray level co-occurrence matrix,GLCM)的几个
交通事件的检测与确认是交通事件管理中的首要问题。基于线圈和视频数据的检测方法由于成本高,检测效果不明显,在实际应用中受到限制。提出了一种基于离群点挖掘的交通事件检测
目前,微博消费意图识别问题成为新的研究热点。然而,已有工作主要判断微博是否具有商业意图,很少研究消费意图内容中消费对象的识别问题,而消费对象的识别是精确地进行商业推
基于回答集(也称稳定模型)语义的带函数析取逻辑程序是一种重要的知识表示和推理方法。由于判定一个析取逻辑程序是否有回答集是困难的(Σ2完全的),目前还没有有效的方法来计算带