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自由交配也叫随机交配，指种群中具有生殖能力的雌雄个体间可以随机交配，不同基因型的个体间都有交配机会且机会均等，既有基因型相同的个体交配，也有基因型不同的个体交配，强调随机性。例：一个种群中，若仅考虑一对等位基因A、a，种群中的基因型有3种：AA、Aa、aa，随机交配包括以下交配类型：AA AA、Aa Aa、aa aa、AA Aa、AA aa、Aa aa。