tRNA来源的小分子RNA预测乳腺癌赫赛汀耐药相关生物标志物的探索性研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chongyou2025
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目的本研究旨在研究一种新型的非编码RNA,即tRNA来源的小分子RNA(tRNA-derived small non-coding RNAs,tDRs)在人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,Her-2)阳性乳腺癌中的表达特征,并探讨其在乳腺癌赫赛汀治疗耐药相关生物标志物筛选中的应用价值。方法首先通过Cell Counting Kit-8(CCK8)细胞增殖毒性实验及AV-PI流式细胞仪检测验证SKBR3及JIMT-1对赫赛汀的药物敏感性,随后通过高通量测序检测SKBR3、JIMT-1及HBL-100中tDRs的表达差异。经过数据分析及筛选后,通过qRT-PCR验证赫赛汀敏感及耐药患者血清中tDRs的表达差异。进一步应用受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC)检测tDR-1960和tDR-1969预测赫赛汀耐药的敏感性及特异性。最后通过COX模型进行多因素分析,判断独立预后因素,评估tDRs表达值与赫赛汀药物疗效的相关性。结果1.高通量测序结果表明tDRs在乳腺癌赫赛汀敏感及耐药细胞系中的表达有显著差异,亚型分析结果提示在SKBR3、JIMT-1、HBL-100这3种细胞系中,tRNA来源的小RNA片段(tRNA derived small RNA fragments,tRFs)的表达量均>80%,显著高于tRNA半分子(tRNA halves,tiRNAs)。2.赫赛汀敏感及耐药患者血清中tDRs表达验证的结果显示,tDR-1960和tDR-1969在赫赛汀耐药患者中的表达显著高于赫赛汀治疗敏感患者,高表达tDR-1960和tDR-1969的患者其无进展生存期(progression-free survival,PFS)显著低于低表达患者。3、ROC曲线下面积表明tDR-1960和tDR-1969表达值区分赫赛汀敏感及耐药患者的特异性和准确性良好。4、最后,我们通过COX多因素分析证明tDR-1960、tDR-1969以及原发肿瘤分期是HER-2阳性乳腺癌患者赫赛汀治疗的独立预后因素。结论tDR-1960和tDR-1969在赫赛汀耐药患者中高表达,且表达值与患者的原发肿瘤分期呈正相关,与预后呈负相关,高表达tDR-1960和tDR-1969的患者预后较差,特异tDRs可作为预测赫赛汀治疗药物敏感性的潜在生物标志物,可能为乳腺癌赫赛汀耐药提供新线索和潜在的干预靶标。
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