高新技术产业开发区是科研成果商品化、产业化的重要基地。我国高新区在经历十五年的发展后，面临着“二次创业”的历史任务。广州高新区作为中国首批国家级高新区之一，经历了三个不同的发展阶段，成为带动广州经济增长、产业结构升级转型的重要引擎。 总体来讲，广州高新区的发展取得了辉煌的成绩，但也面临着体制创新方面的瓶颈。本文在运用区域经济学理论的基础上，探讨了世界、中国两个层面上高新区的概况，运用SPSS经济统计软件对广州高新区进行纵向和横向两个不同维度的实证分析，清晰勾勒出广州高新区的地位及其历年变动情况。在此基础上，总结分析出了广州高新区面临的突出问题，并给出了中肯的策略建议。 体制问题具有特殊的重要性。体制创新和高新区发展是目的和手段的关系，两者存在辩证的互动机制，体制创新能够给高新区发展提供制度上的保障；高新区的发展壮大一方面提出了体制创新的诉求，另一方面提供了体制创新的物质基础。鉴于此，本文在剖析广州高新区体制创新面临问题的基础上，提出了建立健全风险投资体制、管理体制向“基金会管理模式”过渡、管委会内在机制完善、培育科技创新体制等策略建议。