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【目的】
1.筛选并鉴定沉默和过表达SIRT6的人胚胎肾脏细胞(human embryonic kidney 293,HEK293)细胞中差异表达的lncRNAs。
2.揭示SIRT6通过调控lnc-IL17RA-33表达促进DNA损伤修复及影响细胞衰老的分子机制。
【方法】
1.利用lncRNA芯片技术检测沉默和过表达SIRT6的HEK293细胞中lncRNAs的表达。根据lncRNAs表达水平和差异倍数等条件,初步筛选出显著差异表达lncRNAs。
2.利用qRT-PCR技术验证差异表达的lncRNAs(差异倍数≥1.5),其中lnc-IL17RA-33的差异表达具有统计学意义且与芯片筛选结果一致。
3.在HEK293细胞中转染siRNA抑制lnc-IL17RA-33的表达,通过WesternBlotting检测lnc-IL17RA-33对HEK293细胞DNA损伤修复、衰老和增殖的影响。
4.沉默lnc-IL17RA-33后利用mRNA芯片技术检测下游差异表达基因。差异表达基因进行GO分析、KEGG通路分析和蛋白质相互作用分析。根据差异倍数、表达水平等条件初步筛选其下游靶基因。
5.利用qRT-PCR技术验证在芯片中表达显著差异的关键下游靶基因(差异倍数≥1.5),其中ARSB和NFAT5的差异表达是否具有统计学意义。
【结果】
1.沉默和过表达SIRT6的HEK293细胞中差异表达的lncRNAs
芯片结果显示,在过表达SIRT6中上调并在沉默SIRT6中下调的lncRNA有62个(差异倍数≥1.5,P<0.05)。
2.差异表达lncRNAs鉴定
qRT-PCR鉴定结果显示lnc-IL17RA-33在过表达SIRT6的HEK293细胞中上调且在沉默SIRT6的HEK293细胞中下调,与芯片结果一致。
3.lnc-IL17RA-33对HEK293细胞DNA损伤修复、衰老和增殖的影响
结果显示,在HEK293细胞中转染siRNA抑制lnc-IL17RA-33的表达,可以延缓细胞DNA损伤修复;在HEK293细胞中抑制lnc-IL17RA-33能显著抑制衰老相关蛋白p21、p27的表达。
4.干扰lnc-IL17RA-33后差异表达基因分析。
经GO分析lnc-IL17RA-33干扰后差异表达基因主要富集在在生物过程、细胞组分和分子功能等功能。经KEGG通路分析lnc-IL17RA-33干扰后差异表达基因主要参与癌症的途径、PI3K-Akt信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节、粘着斑和轴突指导等通路。其中差异表达最显著的基因是ARSB和NFAT5。
【结论】
1.SIRT6可通过上调lnc-IL17RA-33促进细胞DNA损伤修复。
2.在HEK293细胞中抑制SIRT6引起lnc-IL17RA-33下调,导致衰老相关蛋白p21、p27的低表达,能有效延缓细胞衰老。
3.干扰lnc-IL17RA-33能引起ARSB和NFAT5上调。
1.筛选并鉴定沉默和过表达SIRT6的人胚胎肾脏细胞(human embryonic kidney 293,HEK293)细胞中差异表达的lncRNAs。
2.揭示SIRT6通过调控lnc-IL17RA-33表达促进DNA损伤修复及影响细胞衰老的分子机制。
【方法】
1.利用lncRNA芯片技术检测沉默和过表达SIRT6的HEK293细胞中lncRNAs的表达。根据lncRNAs表达水平和差异倍数等条件,初步筛选出显著差异表达lncRNAs。
2.利用qRT-PCR技术验证差异表达的lncRNAs(差异倍数≥1.5),其中lnc-IL17RA-33的差异表达具有统计学意义且与芯片筛选结果一致。
3.在HEK293细胞中转染siRNA抑制lnc-IL17RA-33的表达,通过WesternBlotting检测lnc-IL17RA-33对HEK293细胞DNA损伤修复、衰老和增殖的影响。
4.沉默lnc-IL17RA-33后利用mRNA芯片技术检测下游差异表达基因。差异表达基因进行GO分析、KEGG通路分析和蛋白质相互作用分析。根据差异倍数、表达水平等条件初步筛选其下游靶基因。
5.利用qRT-PCR技术验证在芯片中表达显著差异的关键下游靶基因(差异倍数≥1.5),其中ARSB和NFAT5的差异表达是否具有统计学意义。
【结果】
1.沉默和过表达SIRT6的HEK293细胞中差异表达的lncRNAs
芯片结果显示,在过表达SIRT6中上调并在沉默SIRT6中下调的lncRNA有62个(差异倍数≥1.5,P<0.05)。
2.差异表达lncRNAs鉴定
qRT-PCR鉴定结果显示lnc-IL17RA-33在过表达SIRT6的HEK293细胞中上调且在沉默SIRT6的HEK293细胞中下调,与芯片结果一致。
3.lnc-IL17RA-33对HEK293细胞DNA损伤修复、衰老和增殖的影响
结果显示,在HEK293细胞中转染siRNA抑制lnc-IL17RA-33的表达,可以延缓细胞DNA损伤修复;在HEK293细胞中抑制lnc-IL17RA-33能显著抑制衰老相关蛋白p21、p27的表达。
4.干扰lnc-IL17RA-33后差异表达基因分析。
经GO分析lnc-IL17RA-33干扰后差异表达基因主要富集在在生物过程、细胞组分和分子功能等功能。经KEGG通路分析lnc-IL17RA-33干扰后差异表达基因主要参与癌症的途径、PI3K-Akt信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节、粘着斑和轴突指导等通路。其中差异表达最显著的基因是ARSB和NFAT5。
【结论】
1.SIRT6可通过上调lnc-IL17RA-33促进细胞DNA损伤修复。
2.在HEK293细胞中抑制SIRT6引起lnc-IL17RA-33下调,导致衰老相关蛋白p21、p27的低表达,能有效延缓细胞衰老。
3.干扰lnc-IL17RA-33能引起ARSB和NFAT5上调。