随着我国进入建设创新型国家的历史进程，作为国家创新体系建设的骨干力量，科学事业单位肩负着科技研发引领经济建设的重要使命。近年来，随着国家研发投入R&D占GDP的比重逐年增大和科技资金投入的不断增加，科学事业单位所控制的资金规模也逐年增大。然而，和不断增长的资金规模相比，科学事业单位的内部控制建设进程缓慢，各种矛盾问题纷纷显现，各大科研院所组织机制、资金监管、预算执行、收支控制等方面出现了很多状况，现行的内部控制制度已经不再适应当今科学事业单位发展的要求。因此，本文针对L科学研究院内部控制建设情况及优缺点进行分析，得出改进L科学研究院内部控制建设的具体方案，以期为我国科学事业单位内部控制建设提供参考和借鉴。　　本文从五个层次对科学事业单位的内部控制建设进行研究。第一部分引言，主要阐述本文研究的目的和意义，对国内外内部控制现状进行描述，将本文研究方法进行归纳，并将创新点进行了简要介绍。第二部分科学事业单位概念界定及内部控制相关理论，介绍科学事业单位概念及梳理内部控制相关理论。第三部分L科学研究院介绍及其内部控制建设情况分析，对L科学研究院在内部控制建设过程中的优势和缺陷进行分析。第四部分L科学研究院内部控制建设改进建议，针对L科学研究院的内部控制建设缺陷提出改进方案。第五部分研究结论与展望。希望通过本文对L科学研究院的改进研究使各大科学事业单位得到些许参考，为科研事业更好更快发展提供一些助力。