农林类上市企业是农林企业与上市公司的综合体，又是连接农户与市场的纽带，企业自身经营的好坏不但关系到企业的长期发展，也涉及到农民的增收和农村的稳定，同时也关系到国家农林产业的发展和整个国民经济的增长。在经济全球化的今天，农林企业本身及其延伸的产业链的发展日益引人瞩目。本论文运用定性与定量相结合的方法，利用2008~2010年间农林类上市企业披露的年度报告和沪深两市证券交易所等机构披露的相关数据，探讨和分析了我国18家农林类上市企业技术效率的现状及公司治理因素对技术效率的影响。论文首先归纳和分析了学者们对于企业投入产出指标体系和公司治理指标体系的研究，在此基础上，构造了评价农林类上市企业技术效率的投入和产出指标体系，并建立了相应的公司治理指标体系。其次，论文构建了评价农林类上市企业技术效率的Translog形式的随机前沿生产函数，运用随机前沿分析方法（Stochastic FrontierAnalysis，SFA）测算了当前农林类上市企业的技术效率，并将公司治理对技术效率的影响状况进行了分析。为了弥补随机前沿分析方法的不足，文中进一步运用数据包络分析方法（Data Envelopment Analysis，DEA）测算了农林类企业的技术效率，之后建立回归模型，进一步分析了公司治理因素对技术效率的影响。在两种实证分析的基础上，论文从技术效率值和公司治理因素对技术效率影响两个角度将两种方法的分析结果进行了对比研究。最后，运用Malmquist指数分析方法研究了技术效率对农林类上市企业全要素生产率（Total Factor Productivity，TFP）的影响，并从公司治理的角度运用系统聚类分析方法对所选取的样本企业进行了分类研究。通过研究发现，由于两种方法的研究原理不同，利用随机前沿分析方法（SFA）测算出的农林类上市企业近三年平均技术效率值要低于利用数据包络分析方法（DEA）所测出的技术效率值，两种方法的结果分别为0.8109和0.9282，虽然两者有一定的差异，但结果都说明当前我国农林类上市企业的技术效率还有一定的提高空间，同时，两种方法的研究结果都表明，林业类上市企业的技术效率要低于农业类上市企业。基于公司治理视角的我国农林类上市企业技术效率的影响因素分析表明，是否为国有控股公司、管理层年度薪酬总额、董事会规模及资产负债率这四个因素对当前农林类上市企业技术效率的影响较为显著，且均为负向作用。从全要素生产率（TFP）变化的角度来看，三年来农林类上市企业全要素生产率（TFP）有所增长，但技术效率对全要素生产率（TFP）的推动作用要小于技术水平进步所带来的影响。最后，根据理论分析和实证检验的结果，本文分别从股权治理、管理层治理、董事会治理和资本结构四个角度提出了适当消减国有股比例和流通股比例、改变高层管理者的薪酬结构、消减董事会规模等改进农林类上市企业技术效率的政策建议。