【摘 要】
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目的:1、通过国际癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库的泛癌数据及GEO（Gene Expression Omnibus）数据库的鼻咽癌的芯片数据分析,研究异常纺锤体样小头畸形相关蛋白（Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM）在恶性肿瘤中的差异表达;2、通过收集临床数据及免疫组
【基金项目】
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广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题《ASPM在鼻咽癌组织中的表达及其临床意义》（项目批准号:Z20211109）； 广西科技基地和人才专项（项B编号:桂科AD20297069）；
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目的:1、通过国际癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库的泛癌数据及GEO（Gene Expression Omnibus）数据库的鼻咽癌的芯片数据分析,研究异常纺锤体样小头畸形相关蛋白（Abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM）在恶性肿瘤中的差异表达;2、通过收集临床数据及免疫组化染色的方法,研究ASPM在鼻咽癌组织样本中的差异表达,及其与鼻咽癌患者临床病理参数和总生存期的相关性;3、通过生物信息学分析的方法,研究ASPM在鼻咽癌中的分子功能及作用机制;4、通过细胞功能检查实验,验证ASPM对鼻咽癌细胞周期及细胞增殖的作用。方法:通过TIMER数据库的在线工具对来源于TCGA数据库的泛癌数据进行分析,了解ASPM在泛癌中的表达情况。从GEO数据库下载鼻咽癌的芯片数据集,使用R语言对鼻咽癌芯片数据集进行差异表达分析。使用免疫组化染色方法分析ASPM蛋白在鼻咽癌中的差异表达,及分析ASPM表达与鼻咽癌患者临床病理参数的相关性;采用生存曲线分析和COX回归模型分析不同病理参数与鼻咽癌患者生存期的关系;使用受试者工作特征（Receiver operator characteristic,ROC）曲线评估各种预后参数预测鼻咽癌患者预后的效能。使用R语言对鼻咽癌芯片数据集进行功能聚类分析。使用STRING数据库构建ASPM与其相关差异基因的蛋白质交互（Protein-protein interaction,PPI）网络,并筛选与ASPM相互作用的蛋白。通过流式细胞术及CCK8实验等方法,研究ASPM对鼻咽癌细胞周期及细胞增殖的影响。结果:通过泛癌数据分析发现ASPM m RNA在TCGA数据库20种恶性肿瘤中高表达。通过鼻咽癌芯片数据分析发现ASPM m RNA在鼻咽癌芯片数据集中高表达（P＜0.001）。免疫组化染色结果显示,鼻咽癌组织标本中ASPM的表达明显高于鼻咽炎组织,具有统计学差异（P＜0.001）。ASPM表达与T分期（χ~2=3.921,P=0.048）及总临床分期（χ~2=4.740,P=0.029）相关。高表达ASPM蛋白组总生存期（Overall survival,OS）短于低表达ASPM蛋白组（P＜0.001）。通过多因素Cox回归模型分析,显示ASPM蛋白表达水平[HR=4.001,95%CI（1.306-12.254）,P=0.015]可能作为独立危险因素影响鼻咽癌患者预后。通过ROC曲线分析,显示ASPM表达[AUC=0.730,95%CI（0.609-0.851）,P=0.001]用于的预测鼻咽癌患者预后具有一定的准确性。功能聚类分析发现ASPM相关的基因主要富集于DNA复制起点结合、受损DNA结合、微管蛋白结合、DNA解旋酶活性等分子功能;富集于DNA复制、细胞周期及错配修复等信号通路。PPI网络分析发现ASPM与DNA复制、细胞周期、DNA修复等通路相关的蛋白有互作关系。细胞功能实验发现,沉默ASPM的表达,鼻咽癌细胞周期停滞于G1期,鼻咽癌细胞增殖减少。结论:1、ASPM基因在多种恶性肿瘤中表达升高,是一个泛癌基因;2、ASPM在鼻咽癌组织中高表达,与鼻咽癌患者较差的生存相关,可能成为鼻咽癌中有价值的预测预后的生物标志物;3、ASPM可能通过调控细胞周期及DNA复制等信号通路,导致鼻咽癌发生与进展;4、沉默鼻咽癌细胞中ASPM m RNA的表达,可以使细胞周期停滞于G1期,细胞增殖减少。
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