罗氏沼虾生殖细胞特异分子标记vasa基因及其启动子的分离和鉴定

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vasa基因编码ATP依赖性RNA解旋酶DEAD-box超家族的蛋白质成员,该家族在后生动物生殖系发育中起关键作用。本研究鉴定了罗氏沼虾生殖细胞特异分子标记一个vasa新基因Mrvasa。Mrvasa的基因组DNA序列由14个外显子和13个内含子组成。Mrvasa的基因组DNA序列的全长为675 kb,这是迄今为止报道的最长的vasa基因序列。Mrvasa c DNA的全长为2516 bp。它包含9个保守的基序,一个锌指基序和RGG重复序列。但其中的TPGRI(Ib)结构域在罗氏沼虾中突变为TVGRV,x Yxx PTPVQ(Q)结构域突变为x Yxx PTPIQ。根据多序列对比分析,Mr VASA与日本沼虾的Mn VASA具有最高的同源性(89%),与脊尾白虾的Ec VASA具有75%的同源性,与中国明对虾的Fc VASA具有55%的同源性。进化树分析结果也证明了Mr VASA率先与其最近缘的日本沼虾VASA聚类,然后与长臂虾科的物种进行聚类。两个结果既与经典分类学进化关系一致,也揭示了本研究获得的Mr VASA可能为罗氏沼虾VASA。此外,RT-PCR结果表明Mrvasa m RNA仅在性腺中特异性表达。定量PCR分析进一步显示,Mrvasa m RNA在精巢中的表达水平比在卵巢中高得多。在精巢发育过程中,Mrvasa m RNA的表达量逐渐上升,并在晚期时表达量达到最高,而在卵巢发育过程中未发现表达的显著差异。原位杂交结果表明,Mrvasa m RNA位于精原细胞,精母细胞和精子的细胞质中。在卵巢中,Mrvasa m RNA位于早期卵母细胞细胞质与细胞核的核仁中,随着卵黄积累,信号被挤压至核周,信号随着GVBD的发生而一起消失。此后,利用生物信息学分析由克隆获得的Mrvasa 5’侧翼序列,预测了5个核心启动子区域。使用双荧光素酶报告基因,确定具有高活性的启动子的转录核心区域。根据检测结果显示,包含有(-387/-337 bp)核心启动子区域的载体启动活性最高,其重组载体的萤火虫荧光素酶的相对活性是空载体的相对活性的2-13倍。此外,缺少(-387/-337 bp)启动子核心区域的重组载体相对活性显著降低,而增加(-617/-567 bp)和(-1063/-1013 bp)核心启动子重组载体的相对活性也显著降低。这些结果表明预测的启动子核心区(-387/-337 bp)是转录调控活性必不可少的真正核心启动子。此外,在(-843/+42 bp)和(-1202/+42 bp)区域中相对活性的显著下调,表明(-843/-424 bp)和(-1202/-843 bp)的片段可能带有某些转录因子的结合位点,对Mrvasa启动子的活性产生负面影响。通过启动子结合位点预测,该区域带有AP-1、Sp1和C/EBPα等结合位点,这些结合位点可能对Mrvasa启动子的活性表达其负调控作用。综上所述,本研究发现了一个新的Mrvasa基因,并探究其时空表达谱,研究分析了该基因的基因组序列,也鉴定了其核心启动区。迄今为止,这是首次鉴定了甲壳动物vasa基因的启动子核心区域。此研究结果将为追踪罗氏沼虾生殖细胞系的形成与发育提供一个有用的生殖细胞特异性标记。
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