香菇是一种重要的食药用菌,分布范围广,是广泛栽培的食用菌之一,多糖具有抗肿瘤、抗衰老、抗氧化、抗菌、抗病毒及免疫调节作用。亲本选配是育种工作成败的先决条件,传统高多糖菌株的筛选需要采收子实体后测定多糖含量,往往过程复杂,且费时费力。因此,研究香菇重要农艺性状的群体遗传规律,可以揭示供试菌株的遗传背景,为后续亲本选配及新品种选育提供理论依据,指导纯系育种理论。同时,开发与多糖含量基因紧密连锁的分子标记,用于筛选高多糖菌株,可以节省劳动力及物力,显著提高筛选速度和育种效率,具有重要的生产实践价值。本研究以香菇菌株“沪香F2”及其自交优良F2代菌株之一“申香1504”为实验材料,收集孢子单核体,对其交配型进行鉴定,然后通过单孢自交的方法,构建F2、F3代群体,并对孢子单核体、F2、F3代群体各阶段培养、出菇情况以及重要农艺性状进行详细统计分析,比较两个群体之间的差异,研究各性状的分化情况、遗传规律及性状间的相关性。同时测定F2、F3代菌株子实体的多糖含量,比较两个群体之间多糖含量的差异,基于BSA法定位与多糖含量相关的位点,开发与多糖含量基因连锁的In Del标记,用于高、低多糖菌株的筛选。主要研究结果如下:（1）通过单孢分离分别获得256和299个“沪香F2”、“申香1504”菌株的孢子单核体,根据孢子单核体四种交配型的数量分别设计了1028和972个自交配对组合。在F2和F3代群体中,配对阶段,分别有15.47%和23.56%的配对组合由于菌丝生长缓慢无法获得后代双核体菌株,且F3代显著高于F2代;生产种培养阶段,出现不良性状的菌株数量分别为7.78%和9.57%;菌棒培养阶段,出现不良性状的菌株数量分别为41.05%和49.28%,且F3代退菌菌株比例显著高于F2代,不转色菌株比例显著低于F2代;出菇阶段,分别有3.11%和4.32%的菌株不现蕾,分别有13.04%和4.32%的菌株出畸形菇,分别有19.55%和8.95%的菌株能出正常菇,且F2代出正常菇的菌株比例显著高于F3代。在“沪香F2”和“申香1504”的孢子单核体中,分别有29.69%和60.20%的孢子单核体,多次配对获得的杂交子,出现了在s PDA上或培养料上不生长或生长较差、菌棒不转色、不现蕾、出畸形菇等不良性状;分别有70.31%和39.80%的孢子单核体,多次配对获得的杂交子中有出正常菇的杂交子;分别有26和8个孢子单核体,多次配对获得的杂交子,出正常菇的概率达50%以上。（2）F2、F3代群体菌株的平均单棒产量、平均单棒菇数、平均单菇重均表现出明显的分化现象,且在两个群体之间存在极显著性差异。与F2代相比,F3代的产量分布、菇数分布表现出偏分离现象,平均单棒产量低于F2代43.84%,平均单棒菇数低于F2代56.77%;与亲本相比,33.83%的F2代菌株产量高于亲本,具有高产特性。同时,菌棒的转色状态与单棒产量成显著性正相关,单棒产量与单棒菇数成极显著性正相关,单棒菇数与单菇重成极显著性负相关。（3）F2、F3代群体菌株的多糖含量均表现出分化现象,且F3代的分化程度低于F2代,同时多糖含量在两个群体之间均符合正态分布。在F2代中有12.04%的菌株多糖含量高于亲本,在多糖含量上表现出超亲优势。基于混池重测序及与参考基因组比对,定位到7个与多糖含量相关的位点,分别位于2号染色体的180000-766000bp、5160000-5190000bp,4号染色体的26800-1977000bp、2810000-3200000bp,7号染色体的40000-970000bp、1840000-2000000bp、2810000-3200000bp,并且在候选区域内开发了47个与多糖含量基因连锁的In Del标记。上述结果分析了“沪香F2”和“申香1504”孢子单核体配对及F2、F3代的培养、出菇情况,探讨了单棒产量、单棒菇数、单菇重在F2、F3代中的遗传规律及相关性,初步定位了与多糖含量有关的候选基因组区域,并开发了与多糖含量基因连锁的In Del标记。后续研究可以结合多群体,验证开发的分子标记与目标性状基因连锁的紧密程度。