【摘 要】
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背景:组成型着丝粒网络(Constitutive centromere associated network,CCAN)是由16个CENPs(Centromere proteins)基因构成的内层动粒复合物,CCAN与CENPA(Centromere protein A)协同作用共同维护细胞分裂过程中的正确分离,是防止形成染色体不稳定和非整倍体的关键。肝癌是全球顽固恶性肿瘤之一,挖掘CCAN在肝癌
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背景:组成型着丝粒网络(Constitutive centromere associated network,CCAN)是由16个CENPs(Centromere proteins)基因构成的内层动粒复合物,CCAN与CENPA(Centromere protein A)协同作用共同维护细胞分裂过程中的正确分离,是防止形成染色体不稳定和非整倍体的关键。肝癌是全球顽固恶性肿瘤之一,挖掘CCAN在肝癌中的关键基因将为临床诊断和治疗提供有价值的潜在生物标志物。方法:通过R和Perl软件挖掘GSE151530单细胞文库聚类细胞亚群并识别易感基因,分析特定细胞亚群的生存、临床特征。基于Kaplan-Meier通过Cox(The proportional hazards model)和q RT-PCR预测及验证CCAN家族中肝癌关键基因。通过小干扰RNA沉默CENPU(Centromere protein U)并以CCK8(Cell counting kit-8)、平板克隆、划痕实验、Transwell研究生物学功能。通过构建稳转株沉默CENPU并以转录组学测序分析CENPU调控机制。结果:发现CCAN家族基因是潜在的肝癌易感基因,与预后不良相关。肝癌细胞CCAN中CENPU的表达差异最显著,CENPU的沉默有效抑制肝癌细胞增殖、迁移和侵袭。整合素/粘着斑网络和ECM/EMT网络是CENPU调控肝癌恶化的分子机制,与转移相关性最高。Hsa-mi R-590-3p可能是CENPU的上游调控因子。结论:CCAN基因家族具有影响肝癌的发展可能性。肝细胞癌中尤其以CENPU影响力最高,且通过整合素/粘着斑轴和ECM/EMT轴调控肝癌细胞转移而加剧预后不良,是早期诊断和精准治疗的可能靶点。
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