【摘 要】
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研究背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是百年来全球发生影响最大的传染病,对全人类健康和社会经济造成巨大威胁。当前,全球COVID-19疫情仍处于大流行态势,我国长期面临“外防输入,内防扩散”的压力,变异毒株使当下的防控形势愈加严峻。当某地暴发新冠肺炎疫情时,寻找传播源头、明晰疫情传播特征、研判疫情态势、评估防控效果对于疫情防控至关重要。目的和意义本研究估计了广州市新型冠状病毒Delta变异株
【基金项目】
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广东省重点领域研发计划(2019B111103001,2020B0101130019);
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研究背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是百年来全球发生影响最大的传染病,对全人类健康和社会经济造成巨大威胁。当前,全球COVID-19疫情仍处于大流行态势,我国长期面临“外防输入,内防扩散”的压力,变异毒株使当下的防控形势愈加严峻。当某地暴发新冠肺炎疫情时,寻找传播源头、明晰疫情传播特征、研判疫情态势、评估防控效果对于疫情防控至关重要。目的和意义本研究估计了广州市新型冠状病毒Delta变异株的关键流行病学参数,并描述其暴发疫情的流行特征,利用传染病传播动力学模型,追溯疫情传播起始时间,评估防控措施效果,为疫情风险研判和防控措施制定提供参考。研究方法收集广州市2021年5月21日至6月18日Delta变异株暴发疫情感染病例数据和防控措施相关数据、广州市街道人口数据和地理信息数据。采用区间删失数据估计方法对潜伏期、序列间隔、代际间隔3个关键流行病学参数进行估计;采用指数增长法(EG)、极大似然法(ML)计算基本再生数(R0),采用序贯贝叶斯方法(SB)计算实时再生数(Rt)。构建SEIR传播动力学模型,基于每日发病人数进行拟合,推测本次疫情的传播起始时间。通过引力模型构建人口出行OD矩阵,构建以街道为空间尺度的网络SEIR模型,模拟在不同防控情景下广州市感染人数和扩散范围,评估防控措施的效果。研究结果1.广州市此次Delta变异株疫情潜伏期为4.60(95%CI:4.04~5.15)天,序列间隔为 2.56(95%CI:1.46~3.66)天,代际间隔为 3.83(95%CI:3.35~4.38)天。通过 ML 法计算得 R0=2.99(95%CI:1.97,4.32);EG 法计算得R0=3.53(95%CI:2.45,5.25)。通过SB法计算实时再生数Rt,5月27日前,Rt迅速从3.5上升到5.1,之后波动下降,在6月6日首次降至1以下并维持在低位水平。2.SEIR模型拟合结果显示广州本次疫情起始时间可能在2021年5月9日至5月11日之间。3.通过采取一系列的防控措施,广州市此次疫情感染人数控制在153例,若未采取防控措施,预估截至2021年6月18日,累计感染人数将超过110万。疫苗接种、医学隔离、交通限制、密切接触者追踪隔离等一系列防控措施,均有效降低了传播风险、遏制了疫情蔓延。研究结论1.新冠病毒Delta变异株较早期流行株传播速度更快、传播能力更强。2.传播动力学模型可辅助追溯疫情传播起始时间,从数理学的角度推演疫情传播起始时间具有现实可行性,为疫情溯源分析提供另一种思路。3.接种疫苗可以有效减小疫情规模,但前提是需要人群达到较高的免疫保护率,因此在接种率较低的地区应继续推进新冠病毒疫苗接种。4.针对Delta变异株暴发疫情,仍需采取有力的非药物干预措施,且此类防控措施需尽早实施。
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