PCR检测中出现的假阳性和假阴性问题分析

来源 :中国保健营养·临床医学学刊 | 被引量 : 0次 | 上传用户:inspisee1999
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  中图分类号:R446 文献标识码:B 文章编号:1004-7484(2011)18-0068-02
  
  开展 PCR 应具有一定的条件,需要一个正规的PCR 实验室,采集标本、核酸提取、扩增及产物分析应在不同的房间进行;需有严密的防污染措施、假阳性和假阴性结果的质控等。实验者应具有一定的分子生物学理论知识及实验技能,能够及时发现和纠正实验中的问题。目前,我国在 PCR 应用中尤其是在临床诊断中存在问题较多,主要表现为:PCR试剂的考核、审查工作薄弱,许多单位实验条件不符合要求,部分操作人员的理论和实验知识水平较低,PCR 的应用范围过宽等,因此造成 PCR 实验结果的可靠性差,出现较多的假阳性、假阴性结果。我们结合两年的实践经验就这个问题做了分析,以提高检验质量,现综述如下:
  1 模板的制备过程
  得到纯正的模板,是PCR检测成功的关键性的一步。而导致这一步假性结果的原因也很多,假阳性是由于核酸的污染造成的。而污染的主要来源有以下几个方面。
  1.1 由于交叉感染所致的标本中含有大量的靶分子。
  1.2 来自微生物的质粒克隆可大量存在于实验室的仪器,设备和试剂中。扩增子的污染是最重要的核酸污染来源,每一PCR容器可含有多达1012拷贝的扩增子,甚至最微细的气溶胶小滴(lO^ul)也含有多达105个潜存的靶分子。
  由于污染对新的核酸扩增有很大影响。因此在操作中,必须注意消除污染和隔离应用一次性的材料,胶管头、试管、操作室要分隔为PCR前和PCR后处理室。
  PCR结果也可能出现假阴性,在模板的制备中可能出现的原因有很多,但在实验时我们发现假阴性最多時是由于试剂和标本的反复冻融。如:试剂中蛋白酶K若反复冻融5次以上,消化蛋白酶K的活力会降低甚至丧失,不能扩增出目的DNA而造成假阴性。据文献报道,冻融2次阳性率降低37.5%。冻融3次阳性率降低57.2%。
  2 扩增
  扩增中出现假阳性和假阴性的原因较少,主要是试剂污染或扩增管污染而造成的假阳性。出现假阴性的主要原因是引物设计不佳,或引物含量较低;另一方面可能是扩增仪的温度低,没有达到变性的温度。低温下复性的要求,这时就要及时测量和调节扩增仪的温度,以保证结果的准确。
  3 电泳
  电泳时操作不规范也会影响结果判定:
  3.1 电泳制胶时,梳子不清洁,胶孔不整齐,而出现星状拖尾或弯曲不齐现象。
  3.2 琼脂糖溶解不充分,影响结果观察。
  3.3 制胶和电泳槽中用的缓冲液应相同,且电泳槽中缓冲液要及时更换。 ‘
  3.4 规范的点样操作是先将胶板放在电泳槽中,以免先点样时样品散落在泳液巾导致阴性结果。
  4 PCR产物的鉴定
  PCR 产物通过琼脂糖凝胶电泳可判断其长度是否为预期的长度,但只有通过杂交试验或序列分析等才能判断其特异性。严格说来,PCR 产物均应通过实验证实其特异性。在我国一些科研论文和临床检测中缺乏这一环节。
  综上所述, PCR 具有其优点,但也有不足之处,它是一种很好的科研手段,但作为常规诊断方法尚需进一步改进和提高。目前的关键问题是如何正确应用 PCR 。虽然 PCR 尚未在包括美国等发达国家作为常规诊断方法,但如果具备开展 PCR 需要的条件, PCR 是可作为辅助诊断手段使用的。目前,只有针对 PCR 应用中存在的问题,采取措施,正确应用 PCR,才能使这一技术在科研和临床工作中发挥应有的作用。
  
  参考文献
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